Работа второго поколения болландистов шла медленнее и слабее, которые до 1773 г., когда орден иезуитов был расформирован, успели выпустить ещё 30 частей издания (до 7 октября). Уничтожение иезуитского ордена и превращение самого монастыря болландистов в Антверпене после 1788 г. в военную школу нанесли чувствительные удары всему предприятию. На деятельность болландистов был наложен также запрет австрийским правительством, и им пришлось перебраться в монастырь Кауденберг в Брюсселе, а с 1786 г. – в аббатство Тонгерло (работа была завершена в 1794 г.). Агиографы смогли получить пристанище в брюссельском монастыре Кауденберг и некоторую материальную помощь только благодаря содействию Марии Терезии и уже в 1780 г. выпустили четвёртый том октября. Но требование императора Иосифа II (1765–1790 гг.) ежегодно выпускать по тому и закончить издание в 10 лет было для болландистов новым ударом (после 1788 г. они были вынуждены продолжить работу на собственный страх). Заручившись поддержкой брабантского аббатства Тангерло, куда болландисты перенесли свою библиотеку, они в 1794 г. выпустили в свет 53-й том своей коллекции («Tangerloer-Band»). Во время Французской революции библиотеки болландистов были разграблены. Они прекратили свою деятельность, несмотря на высказываемые французской академией и Наполеоном пожелания, и возобновили её только в 1837 г., после легализации ордена иезуитов в Бельгии (национальное чувство бельгийцев напомнило об учёных иезуитах, когда в Бельгии распространились слухи об образовании в Париже учёного кружка, намеревающегося продолжить издание). Тогда же болландисты применили новые методы работы с текстами, публикуя различные их варианты, а также добавляя их греческие, коптские, эфиопские, сирийские, арабские и другие оригинальные тексты. Правительство дало субсидию, возникло общество необолландистов, выработавшее программу «De prosecutione operis Bollandiani, quod Acta Sanctorum inscribitur». Первая новая публикация вышла в 1845 г. С 1845 г. издание непрерывно продолжалось до 1867 г. (12-я часть октября). К 1000-летнему юбилею (1863 г.) начала христианизации славян равноапостольными Кириллом (Константином) и Мефодием болландисты издали отдельный том «Annus Ecclesiasticus Graeco-Slavicus», составленный русским иезуитом, историком и агиографом И. Мартыновым. В этот том, переизданный в 1870 г. в качестве 11-го тома «Acta sanctorum Octobris», вошли имена святых, которые почитаются в славянских Восточных католических церквах, а также имена многих православных святых. В 1870 г. правительственная субсидия у болландистов была отнята, и в то же время усложнились задачи: открылись новые архивы (Ватиканский), появились новые инвентари манускриптов, развилась и выработалась сама техника издания. Во главе работ последнего поколения болландистов с 1877 г. становится отец де Смедт (ум. в 1911 г.), стремившийся примирить устаревший и неудобный план издания с требованиями современной науки и критики. Наряду с продолжением издания (в 1911 г. появился 65-й том), Смедт со своими сотрудниками предпринимает целый ряд изданий (способствующих главной цели), в которых находят место исследования и манускрипты, подготавливающие новые тома и дополняющие и исправляющие уже устаревшие части грандиозного предприятия, «вызывающего чувство почти религиозного уважения». С 1882 г. болландисты начали издавать ежеквартальное обозрение «Analecta Bollandiana», посвящённое исследованиям в области агиографии и публикациям неизвестных ранее документов и содержащее дополнения к уже опубликованным томам, а также серию «Subsidia Hagiographica», включающую научные исследования и списки агиографических источников из библиотек и музеев мира. Другое издание – «Subsidia hagiographica» (с 1886 г.) – включает списки всех агиографических источников: «Bibliotheca hagiographica latina», «Bibliotheca hagiographica graeca», «Bibliotheca hariographica orientalis». Кроме того, болландистами был издан ряд работ по хронологии Римских пап, Константинопольских патриархов, работы о списках епископов Александрии, Иерусалима, Милана. В 1940 г. под руководством И. Делайе (ум. в 1941 г.) было предпринято критическое издание Римского мартиролога (Martyrologium Romanum). К 1940 г. «Acta Sanctorum» состояли из 68 томов in folio (от 1 января до 10 ноября), включая «Комментарий к Мартирологу св. Иеронима» (1931 г.) и «Введение к житиям святых декабря» (Propylaeum ad acta sanctorum Decembris / Ed. H. Delehaye. Brux.; 1940 г.). В 1966–1971 гг. было предпринято репринтное издание первых 60 томов. Издаваемые болландистами материалы являются ценнейшими историческими источниками. В настоящее время болландистов насчитывают 8 чел., а их резиденция находится в Брюсселе.