Католики укрепили свою власть в 1893 г., приняв закон, предоставивший право голоса всем мужчинам старше 25 лет. После появления энциклики папы Льва XIII «Rerum novarum» (1891 г.) в Бельгии стали организовываться католические профсоюзы. В 1904 г. создан Генеральный секретариат христианских профсоюзов, преобразованный в 1909 г. в Конфедерацию христианских профсоюзов. В XX в. во время Первой и Второй мировых войн Бельгия была оккупирована германской армией. На территории Бельгии происходили активные военные действия. Споры о системе образования оставались довольно острыми и во второй половине XX в. В 1950 гг. конфликт по поводу государственного субсидирования частных (католических) школ угрожал единству Бельгии. В 1955 г. социалистическая и либеральная партии объединились, чтобы принять законы, сокращавшие расходы на частные школы. После того как социально-христианская партия (бывшая католическая партия, исключившая из своей программы пункты о сугубо конфессиональном характере) в 1958 г. возглавила правительство, был разработан компромиссный закон, ограничивший долю приходских церковных учреждений, финансировавшихся из государственного бюджета. Представители католической церкви в Бельгии принимали непосредственное участие вво втором Ватиканском соборе. Кардинал Лео Йозеф Сюненс был одним из четырёх модераторов Собора, епископ Брюгге Эмиль Жозеф де Смедт был одним из разработчиков «Декрета о религиозной свободе», профессора Лувенского католического университета Г. Филипс, Л. Серфо и Г. Тильс принимали участие в создании догматической конституции «Lumen gentium» и пастырской конституции «Gaudium et spes». В 1967 г. католической Епископской конференцией была создана Католическая экуменическая комиссия, в составе которой секции по диалогу с англиканами, православными, протестантами и иудаистами, и комиссия по отношениям с мусульманами. Во второй половине XX в. в Бельгии обострилась национально-языковая проблема. В 1967 г. католическое епископство Льежа было поделено на фламандскоязычное епископство Хасселта и франкоязычное епископство Льежа, в 1970 г. Лувенский университет был разделён на фламандско- и франкоязычные университеты (Katholike Universiteit Leuven и Université catholique de Louvain). С 1970 г. проводилась государственная конституционная реформа с целью преобразовать Бельгию в федеративное государство.