После его победы над крестоносцами высокомерие одолело султана, и он стал общаться с эмирами грубо и подписывать документы только буквами «KH», игнорируя эмиров. Кроме того, его визирь Ибн ас-Салус вызывал ненависть эмиров, поскольку не был ни мамлюком, ни эмиром, а был купцом из Дамаска. В то время как Аль-Ашраф Халиль пренебрегал эмирами, он был очень щедр к Ибн ас-Салусу, который был вовлечён в несправедливое преследование верховного судьи Египта Ибн аль Бинт-Ааза и постоянно ссорился с визирем Байдарой. В декабре 1293 г. Аль-Ашраф Халиль в сопровождении Ибн ас-Салуса, Байдары и других эмиров отправился в Ком Туругу в северном Египте на соколиную охоту. Он послал Ибн ас-Салуса в соседний город Александрию, чтобы привезти припасы и собрать налоги. Прибыв в Александрию, Ибн ас-Салус выяснил, что представители Байдары уже собрали все налоги. Получив сообщение от Ибн ас-Салуса, султан вызвал Байдару в свой шатёр, оскорблял его и угрожал ему в присутствии других эмиров. Байдара оставил шатёр и позвал Ладжина, Сункура и других эмиров, и вместе они решили убить султана. 14 декабря султан со своим другом эмиром Шихаб ад-Дином Ахмадом был атакован и убит Байдарой и его последователями. Эмирами, которые поразили султана после Байдары, были Ладжин и Бахадир Пак-Нуба. После убийства Аль-Ашрафа Халиля Байдара и его последователи пошли в шатёр султана и провозгласили Байдару новым правителем. Но Байдара вскоре был арестован мамлюками султана и эмирами, а затем убит Китбугой и Бейбарсом аль-Джашникром, а его голова была отправлена в Каир. Ибн ас-Салус был арестован в Александрии и отправлен в Каир, где подвергался жестокому обращению и, наконец, забит до смерти. Эмиры, которые были вовлечены в убийство Аль-Ашрафа Халиля, были сурово наказаны и казнены. Ладжин и Сункур бежали. После смерти Аль-Ашрафа Халиля эмиры решили короновать его девятилетнего брата Ан-Насира Мухаммада с Китбугой в роли вице-султана и аш-Шуджаи в качестве визиря. Но смерть Аль-Ашрафа Халиля была скрыта на некоторое время. От имени уже мёртвого Аль-Ашрафа Халиля было составлено послание для эмиров от Египта до Сирии: «Я назначил моего брата аль-Малика ан-Насира Мухаммада своим наместником и наследником, так что, когда я иду бороться с врагом, он заменяет меня». Только после этого было объявлено о смерти Аль-Ашрафа Халиля. Аль-Ашраф Халиль правил около трёх лет и двух месяцев. Имел двух дочерей. Помимо завоевания Акры запомнился как умный человек, который любил читать и учиться.