Сплошной высокий иконостас длиной более 21 м включал два придельных иконостаса. За алтарями церквей Зверина монастыря находились древняя скудельница и монастырское кладбище. Близ Покровской церкви около 1807 г. была похоронена некая монастырская старица, дожившая до 130 лет. В 1851 г. у входа в церковь был погребён писатель, государственный и общественный деятель, дипломат, член Российской академии, сенатор Иван Матвеевич Муравьёв-Апостол. При строительстве нового собора его могила оказалась под алтарной частью, мраморная плита была снята, но место захоронения повторно обнаружено игуменьей Ангелиной (Денисовой), о чём сообщил на заседании Новгородского общества любителей древности граф В.В. Муравьёв-Амурский. По мнению исследователей, с этим связано избрание игуменьи Ангелины действительным членом общества 24 мая 1908 г. В советский период монастырский некрополь, располагавшийся к востоку от храмов, уничтожен, сохранились только кирпичная часовня-усыпальница с шатровым верхом и две надгробные плиты. В 2001 г. за алтарём Покровской церкви поставлен гранитный поклонный крест в память похороненных на скудельнице новгородцев (мастер Л.Ф. Степанов, Новгород). К Зверину монастырю были приписаны церкви упразднённых Белого во имя святителя Николая Чудотворца (в 1764 г.) и Лазаревского женского (как полагают исследователи, в 1816 г.) монастырей. Примыкающий с юга к территории Зверина монастыря Белый (Николо-Бельский, Николая Белого) монастырь составляет с ним единый комплекс. В 1135–1136 (или в 1144) гг. неким Ирожнетом (Рожнешем) была построена Никольская церковь. Однако в данном случае, по мнению исследователей, речь идёт об ином храме в том же районе и с тем же посвящением. Собственно Белый монастырь впервые упоминается в связи с закладкой Новгородским архиепископом Давидом «на своём дворищи» в 1312 г. каменного собора и устройством обители. В 1521 г. игуменом Илиёй Цветным был устроен придел «на сенях» во имя пророка Илии. Исследователи полагают, что вскоре после введения в обители общежития (1552 г.) была построена каменная трапезная Ильинская церковь (упоминается в описи 1583–1584 гг. наряду с Никольской церковью, имевшей Петропавловский придел). Земельные владения обители по реке Гзень граничили с угодьями упразднённого в XVII в. Борисоглебского монастыря. После Смуты, по описи 1615 г., каменные церковь и трапезная были «разорены, келей и ограды нет… старцов и слуг того монастыря нет ни единово человека». В 1623–1628 гг. монастырь был возобновлён по указу царя Михаила Фёдоровича, подтверждены его права на вотчины и угодья, в том числе в Кожевниках (1641 г.). 5 февраля 1672 г. деревянные строения сгорели. В 1685–1764 гг. монастырь приписан к Новгородскому архиерейскому дому, в монастыре открылась больница. Наряду с Никольской церковью за деревянной оградой находились трапезная каменная Ильинская церковь и надвратная каменная колокольня, к началу XIX в. они были разобраны. Между 1845 и 1860 гг. Никольская церковь была возобновлена; пристроены новый обширный притвор и северный придел на месте древних (XVI в.?).