Время местной канонизации Вассиана Строкинского исследователям неизвестно, не известны ни Житие, ни служба святому. В начале XIX в. его мощи находились в приходской церкви, в которую был преобразован главный храм монастыря, упразднённого в 1764 г. В 1911 г., после учреждения Каргопольского викариатства Олонецкой епархии, монастырь стал резиденцией Каргопольского епископа. К настоящему времени монастырские постройки не сохранились. Почитание святого подтверждено включением его имени в Собор всех святых, в земле Российской просиявших (празднуется в Неделю вторую по Пятидесятнице). В сводном Иконописном подлиннике (XVIII в.) описание образа Вассиана Строкинского помещено под 3 сентября: «Преподобнаго отца нашего священноинока Вассиана, начальника Преображенскаго монастыря, иже в Строкине, пустынника Каргопольскаго, на Онеге реце, новаго чудотворца; подобием сед, брада поменьше Иоанна Богослова, на главе схима, ризы преподобническия». В агиологической литературе XIX в. Вассиана Строкинского иногда называют Вассианом Крестомировским (Крестиморовским, Кратемировским). Архиепископ Сергий (Спасский) в списке неканонизированных русских святых упоминает «Вассиана, начальника Кратемировского (или Крестомировского) монастыря на Онеге реце». Евгений Евстигнеевич Голубинский различал двух святых: Вассиана Строкинского, основавшего свой монастырь близ Каргополя не позднее первой четверти XVI в., и Вассиана Крестомировского, подвизавшегося близ Белого моря «неизвестно когда». В списке архимандрита Леонида (Кавелина) указан Василий, основатель Кратемировского монастыря близ Белого моря. Появление легенды о существовании св. Вассиана (Василия) Крестомировского исследователи готовы объяснять тем, что Пертоминский в честь Преображения Господня мужской монастырь на Белом море, основанный на месте гибели Вассиана и Ионы Пертоминских, в XIX в. мог именоваться Крестиморовским, таким образом, небесный покровитель обители – преподобный Вассиан Пертоминский мог именоваться Крестиморовским. По-видимому, в результате смешения двух пришедших в упадок в XIX в. Преображенских монастырей на Белом море (на месте гибели Пертоминских чудотворцев и Строкиной пустыни на Онеге) основатель последней Вассиан Строкинский также в литературе XIX в. может именоваться Крестомировским.