Постоянное внимание редакции журнала «Вера и Церковь» было обращено на публикацию материалов, которые относились к деятельности Московского митрополита Филарета (Дроздова). О проблеме сближения православной церкви со старокатоликами писали в журнале «Вера и Церковь» протоиерей Алексей Петрович Мальцев и профессор Казанской духовной академии Алексей Фёдорович Гусев. В 1901–1904 гг. в журнале «Вера и Церковь» была опубликована переписка профессора Николая Ивановича Субботина с архимандритом Павлом (Прусским). Журнал старался реагировать на современные общественные теории и проблемы: на его страницах разбиралось содержание идеи прогресса, социалистических учений, отношение к смертной казни, убийство на дуэли и т.д. Ряд статей был посвящён религиозным взглядам и отношению к православной церкви Льва Николаевича Толстого (статьи священника С. Страхова, священника И. Соловьёва и др.). Протоиерей К. Галахов, священник Е. Попов, Иван Иванович Добросердов анализировали «неохристианские» учения о войне, патриотизме и непротивлении злу. Протоиерей Тимофей Иванович Буткевич, И.В. Соболевский и др. дали оценку русскому переводу книги Жозефа Эрнеста Ренана «Жизнь Иисуса». На страницах журнала было уделено большое внимание христианскому значению русской литературы (статьи священника Николая Григорьевича Побединского о религиозно-нравственных идеалах Николая Васильевича Гоголя и Фёдора Михайловича Достоевского, Сергея Васильевича Рождественского – об Александре Сергеевиче Пушкине). Публиковались статьи о религиозно-нравственном образовании в светской и духовной школах, о необходимости единения школы с церковью (статьи епископа Георгия, протоиерея Н.В. Благоразумова, протоиерея А.А. Беляева, священника С.В. Страхова, священника В.М. Гобчанского, А.И. Миловидова и др.). Протоиерей И. Соловьёв напечатал в 1907 г. пять статей из своих уроков по Закону Божию в императорском Лицее и цикл статей «Из чтений в школьной комиссии Монархического собрания в Москве», в которых обсуждались вопросы религиозно-нравственного воспитания детей в школе, церковные идеи в преподавании гражданской истории. Многие статьи журнала представляли собой доклады, прочитанные на публичных богословских чтениях, которые Общество любителей духовного просвещения проводило ежегодно с 1897 г. (в журнале «Вера и Церковь» было напечатано 38 докладов). В библиографическом отделе редакция знакомила читателей со всеми новейшими сочинениями богословско-апологетического и учебного содержания (нередко снабжая их строгими критическими оценками), за годы издания в журнале было рассмотрено около сотни учебных руководств и пособий по Закону Божию. В 1902 г. в приложении к журналу вышла книга епископа Михаила (Грибановского) «Святой апостол Павел и его послания: Из академических лекций». Из-за снижения числа подписчиков издание журнала «Вера и Церковь» прекратилось после выпуска в 1907 г. двух объединённых номеров.