Сохранилось несколько сборников, написанных частично или полностью Вассианом Кошкой и включающих в себя его сочинения: хранящиеся в Историческом музее; хранящиеся в Российской государственной библиотеке (все полностью переписаны Вассианом Кошкой). Как и многие другие постриженики Иосифова Волоколамского монастыря, Вассиан Кошка активно занимался сбором и перепиской произведений, созданных в стенах этой обители (особенно много их в рукописях Российской государственной библиотеки и Исторического музея). Вассиан Кошка переписал Волоколамский Патерик и дополнил его собственным сочинением – Житием преподобного Фотия, его рукой переписаны «Преподобнаго Иосифа игумена... от слова 11 духовныя грамоты, яко подобает настоятелю учити и наказывати сущих под ним», «Слово кратко», посвящённое борьбе между сторонниками и противниками церковного землевладения, статья «О вражде старцев Кирилло-Белозерского монастыря на иосифлян», житие Кассиана Босого, наставника Фотия, «Повесть» о Пафнутии Боровском и др. Исследователи точно установили авторство Вассиана Кошки в отношении двух произведений. Во второй половине 1550 – начале 1560 гг. он написал житие преподобного Фотия Волоколамского, основанное на рассказах о старце его учеников Феодосия Луковниковского и Исаии Ртищева, которых Вассиан Кошка расспрашивал «незадолго время до преставления» Фотия (святой скончался 9 марта 1554 г.). О последних часах жизни преподобного после его кончины Вассиану Кошке рассказал Исаия. Незадолго до своей смерти Вассиан Кошка создал слово «О преставлении святого епископа Тверского Акакия и о житии его вкратце» (сохранилось в списке последней трети XVI в. – Российская национальная библиотека). По мнению архимандрита Макария (Веретенникова), прямая речь, которую Вассиан Кошка в изобилии приводит в Слове, «с большой долей вероятности передаёт подлинные слова Акакия и правдиво описывает повседневную жизнь и благочестие святителя». В научной литературе Вассиану Кошке приписывают авторство азбуковника, Жития преподобного Кассиана Босого, статьи «О вражде старцев Кирилло-Белозерского монастыря на иосифлян». Однако его авторство в отношении данных текстов исследователи не могут считать окончательно доказанным.