В мае 1946 г. Министерство финансов Югославии расторгло договор с Сербской церковью об аренде Дома княгини Любицы, поэтому все предметы к концу года были перевезены в здание Сербской патриархии. 14 июня 1954 г. при участии Сербского патриарха Викентия (Проданова) состоялось торжественное открытие музея в здании Сербской патриархии. С 1990 по 2005 гг. управляющим музеем был профессор Слободан Гойко Милеуснич, затем – М. Илич (до 2010 г.) и В. Радованович (по настоящее время). В 2011–2013 гг. были проведены реконструкция музея, реставрация, съёмка и оцифровка многих его экспонатов. Помимо постоянной экспозиции в музее регулярно проводятся выставки. Фонды музея Сербской православной церкви составляют иконы, церковное шитьё, богослужебная утварь, рукописные и печатные богослужебные книги, портреты, графика, награды, архивные документы и др. Большинство предметов были получены во время экспедиций Лазаря Мирковича и Радослава Груича после Второй мировой войны, из ризниц монастырей Фрушка-Горы и подарены организациями и частными лицами. Среди дарителей выделяются общество «Караджордже», Сербская церковная община в Стамбуле, Сербский патриарх Герман (Джорич), Браничевский епископ Хризостом (Войинович), Шумадийский епископ Савва (Вукович), профессор Душан Кашич, художник Павел (Пая) Йованович, скульптор Джордже Йованович, архитектор Александр Дероко, академик Милан Костич и др. Исследователи отмечают, что особую ценность представляет коллекция Радослава Груича, которая по своему объёму и значимости может составить самостоятельный музей. По количеству и ценности экспонатов музей Сербской православной церкви занимает второе место после ризницы и библиотеки афонского монастыря Хиландар. Иконы представлены образами XV–XIX вв., в том числе сербских художников Андрия Раичевича, Николы Нешковича, Димитрия Бачевича, Стефана Тенецки, Григория Давидовича-Опшича, Теодора Димитриевича-Крачуна, Теодора Илича Чешляра, Остоя Мркоевича, Козьмы Дамьяновича, Г. Чалмански, Х. и Ж. Петровичей, А. Свиленгачина, И. Димитриевича, Георгия Бакаловича, Шпиро Боцарича, Арсений Теодоровича, Павле Йовановича, Уроша Предича, Беты Вуканович, Мило Милуновича и Йована Биелича. Также в музее хранятся 50 русских икон преимущественно второй половины XVIII в. и несколько греческих икон XVIII–XIX вв., находившихся раньше в сербской часовне Саввы Сербского в Константинополе. Из богослужебной утвари выделяются монументальное распятие с предстоящими Пресвятой Богородицей и апостолом Иоанном Богословом конца XVII в., которое до начала Второй мировой войны было частью иконостаса в храме монастыря Велика-Ремета (см. Ремета), и царские врата первой половины XVII в. из монастыря Язак.