Со второй половины XVII в. о местном почитании Мстислава Андреевича свидетельствует его упоминание вместе с отцом и братьями в ряде списков «Росписи, что во Владимире у Пречистые Богородицы лежат благоверные и великие князи и княгини и их дети и епископы», а также в «Описании о российских святых». По наблюдениям Алексея Владимировича Сиренова, в XVII–XVIII вв. наряду с другими великими князьями, княгинями и епископами Мстислав Андреевич почитался не только как местный святой, но и как исторический деятель. В конце XVII в. в надгробном листе князя Глеба Андреевича сообщалось, что на его похоронах присутствовал отец, Андрей Юрьевич Боголюбский, и брат, Мстислав Андреевич, которые «положиша честное тело его зде, в славном граде Владимире в соборной церкви Пресвятыя Богородицы Златоверхия, на сем месте». Отдельный надгробный лист во владимирском Успенском соборе был посвящён Мстиславу Андреевичу. В нём отмечаются его сила, мужество, личная храбрость и подчёркивается, что князь «повелением отца своего многие грады и земли сопротивных непокаряющихся разорил и попленил и под нозе покорил». При этом особо упоминались действия Мстислава Андреевича в Волжской Булгарии, где он «всю землю поимал и попленил и многих во святое крещение просветил, а непокаряющихся мечю предавал». В Мстиславе Андреевиче люди видели «своего заступника», который «прославиша Господа Бога и Пресвятую Богородицу». Князь был «велми добродетелен и милосерд ко христианом», на его похоронах великий князь Андрей Юрьевич Боголюбский «плакашеся» вместе с людьми своей земли «великим плачем» (Российская государственная библиотека, список конца XVII в.). Гробница князя первоначально находилась в западном углу северной галереи Успенского собора во Владимире, однако, «возможно, в связи с сооружением в 1848 г. деревянной лестницы на хоры, или раньше, может быть, в XVII или XVIII в. – её поставили в другое место, вглубь галереи, справа (то есть восточнее) от северного портала собора» (Тимофеева Т.П. «Исследования по истории владимирского Успенского собора». М.; СПб., 2013 г.). Некая «мраморная статуя» у нового места погребения Мстислава Андреевича считалась в XIX в. поставленной Андреем Юрьевичем Боголюбским в память о сыне. В 1882 г., во время реставрации Успенского собора, в нём были приведены в порядок княжеские гробницы, а останки Мстислава Андреевича освидетельствованы. 12 и 15 февраля 1919 г. мощи Владимирских святых, очевидно, и Мстислава Андреевича, подверглись вскрытию. Они были возвращены церкви в 1950 гг. (до 1958 г.), в настоящее время почивают во владимирском Успенском соборе. Канонизация Мстислава Андреевича подтверждена включением его имени в Собор всех святых, в земле Российской просиявших, празднование которому было восстановлено определением поместного Собора от 26 августа 1918 г. («Мстислав Владимирский»); список святых впоследствии пополнялся.