27 июля 1945 г. глава Инициативной группы Г.Ф. Костельник обратился с письмом к патриарху Алексию I (Симанскому), уведомив его о создании группы и планах её работы. К тому времени за воссоединение с православием высказалось уже 340 униатских священников. Г.Ф. Костельник сообщил, что многие клирики боятся открыто присоединиться к Инициативной группе из-за угроз со стороны националистов, однако выразил уверенность, что «священство потянулось в православие, а вслед за ними пойдёт и весь народ». После присоединения к Инициативной группе большинства греко-католического духовенства Г.Ф. Костельник предполагал организовать совещания благочинных, а потом и общецерковный Собор УГКЦ, который и вынесет решение о воссоединении с РПЦ. 3 октября глава Инициативной группы вновь обратился с посланием к патриарху Алексию I (Симанскому), сообщив, что к группе присоединилось уже больше 800 униатских священников, а к конце 1945 г. ожидается присоединение основного состава духовенства, за исключением небольшого количества «упорствующих». В связи с этим был поднят вопрос о завершении первого этапа процесса воссоединения и о начале непосредственной подготовки к проведению объединительного Собора, которому по предложению Г.Ф. Костельника должны были предшествовать епархиальные съезды. Вопросы организации воссоединения униатов с РПЦ обсуждались в патриархии и во время визита главы Инициативной группы в Москву в конце октября того же года. По результатам обсуждения патриарх Алексий I (Симанский) направил в начале декабря 1945 г. письмо председателю Совета по делам РПЦ Г.Г. Карпову, обратив особое внимание на предлагаемый Г.Ф. Костельником сложный, двухступенчатый характер проведения воссоединения: сначала на уровне епархий, потом – всей УГКЦ. Патриарх высказал мнение о возможности ограничиться проведением только епархиальных съездов. Также он обосновал необходимость разрешить непосредственное (помимо Инициативной группы) присоединение отдельных униатских приходов к РПЦ. Такие случаи действительно имели место. Например, в Дрогобычской области перешли в православие 32 униатских прихода, не имевшие связи с Инициативной группой. Речь, как полагают исследователи, шла о греко-католических общинах, которые были покинуты своими клириками, бежавшими на Запад. Паства таких приходов нередко обращалась напрямую ко Львовскому епископу Макарию (Оксиюку), который направлял для окормления священников РПЦ, присоединявших верующих к православию (о подобных случаях епископ Макарий (Оксиюк) писал патриарху Алексию I(Симанскому)  в августе 1945 г.). Также в письме Г.Г. Карпову патриарх сообщил, что считает нужным провести посвящение в епископский сан нескольких священников, перешедших в православие из унии и отвечающих каноническим условиям к кандидатам в архиереи православной церкви. Вскоре в Киеве состоялось совещание для разработки окончательного плана мероприятий по переходу греко-католиков в православие. В совещании приняли участие председатели Совета по делам РПЦ и Совета по делам религиозных культов Г.Г. Карпов и И.В. Полянский, уполномоченные этих Советов при правительстве УССР и руководства Инициативной группы.