Редакция кардинала Пандульфа была переработана монахом Пьером Гийомом, библиотекарем аббатства Сен-Жиль (этот текст содержится в рукописи, созданной в 1142 г. в приорате Сен-Жиль-д'Аси). В манускрипте сохранились глоссы историка и юриста Ландольфо Колонны (ум. в 1331 г.), сотрудника папской канцелярии Джованни Каваллини деи Черрони (ум. в 1349 г.) и канониста Пьера Бойе (Буайе), епископа Орвието (ум. в 1388 г.). Глоссы Пьера Бойе содержатся также в рукописи, которая является копией манускрипта Пьера Гийома, выполненной Пьером Бойе; в них «Liber Pontificalis» рассматривается как источник канонического права: Пьер Бойе использовал прецеденты, заимствованные из папских биографий, чтобы доказать необходимость реформы церкви. «Деяния Римских понтификов» – другая редакция «Liber Pontificalis», составленная кардиналом Бозоном, племянником папы Адриана IV (1154–1159 гг.). В неё включены краткие биографии понтификов X–XI вв., основанные, главным образом, на сочинениях «К другу» и «Книга о христианской жизни» Бонизона, епископа Сутри, а также оригинальные жизнеописания Римских пап от Геласия II (1118–1119 гг.) до Александра III (1159–1181 гг.). Редакция кардинала Бозона содержится в некоторых рукописях «Liber Censuum», составление которой было завершено в 1192 г. кардиналом Ченчо (впоследствии папа Гонорий III; 1216–1227 гг.). После XII в. в распоряжении сотрудников папской курии не было текста первоначальной версии «Liber Pontificalis». Жизнеописания Иннокентия III (1196–1216 гг.) и некоторых его преемников, составленные в XIII в., представляют собой, по мнению исследователей, самостоятельные произведения, не связанные с «Liber Pontificalis». Источниками сведений об истории папства служили энциклопедический свод Винцентия из Бове (ум. около 1264 г.), «Хроника пап и императоров» Мартина из Троппау, основанные на «Liber Pontificalis», и другие произведения, в том числе «Перлы хроник» («Flores chronicorum») доминиканца Бернара Ги, «Церковная история» доминиканца Толомео из Лукки, «Деяния Римских понтификов» папского капеллана августинца Амальрика Оже и сборник папских биографий, составленный премонстрантом Петром из Херенталса. Новые жизнеописания, продолжавшие «Liber Pontificalis», стали появляться только после того, как Лоренцо Колонна привёз в Рим рукопись, в которой содержался текст памятника в редакции Пьера Гийома. На основе этой рукописи и её копии сотрудники папской курии составили ряд дополнений, сохранившихся в манускриптах XV–XVI вв. Эти биографии, по мнению исследователей, различаются объёмом текста и степенью детализации, но, как правило, в них не даётся полного обзора деятельности понтифика; их важнейшие источники – сочинения Мартина из Троппау и Бернара Ги. Наиболее подробно, по мнению исследователей, описана история «великой схизмы» и обстоятельства её преодоления. Большинство дополнений завершаются жизнеописанием Мартина V (1417–1431 гг.); самая поздняя версия, составленная при папе Пии II (1458–1464 гг.), включает его краткую биографию. По поручению папы Сикста IV (1471–1484 гг.) Платина составил «Книгу о жизни Христа и всех понтификов» (между 1471 и 1474 гг.; издано в 1479 г.) – последний из сборников биографий Римских пап, созданных по образцу «Liber Pontificalis». Кроме «Liber Pontificalis» Платина использовал «Церковную историю» Толомео Луккского и «Исторические декады от падения Римской империи» Флавио Бьондо в редакции кардинала Энеа Сильвио Пикколомини (папы Пия II).