8 октября 1966 г. постановлением Священного Синода РПЦ был определён епископом Свердловским и Курганским, временно управляющим Челябинской епархией. 23 октября в Сергиевском трапезном храме Троице-Сергиевой лавры патриарх Алексий I (Симанский) возглавил хиротонию Климента. Ещё находясь в Москве, Климент на приёме у председателя Совета по делам религий при Совете Министров СССР Владимира Алексеевича Куроедова и его заместителя Василия Григорьевича Фурова просил принять заявление верующих об открытии второго храма в Свердловске и разрешить колокольный звон в Свердловской области, но получил отказ. С первых шагов в управлении Свердловской и Челябинской епархиями Климент активно занимался практической богослужебной и церковно-административной деятельностью, проявляя себя, по выражению сотрудников Совета по делам религий, «ревностным церковником». Уполномоченный Совета по делам религий по Свердловской области в отчётах обращал внимание на строгое следование Климентом церковным канонам и заповедям: «…Его мир ограничивается церковью, епархиальным управлением и домом». Отмечалось, что священники кафедрального собора города Свердловска называли Климента «молитвенником» (Государственный архив Российской Федерации). Богослужения Климент совершал благолепно и торжественно, не допуская сокращений; ему сослужили не меньше четырёх – шести молодых иподиаконов. Архиерейские службы стали проводиться им два – три раза в неделю; он взял на себя чтение акафистов в кафедральном соборе. Несмотря на преклонный возраст и слабое здоровье, Климент совершал частые поездки по приходам Свердловской и Челябинской епархий, посетив к концу 1968 г. все приходы, в некоторых побывал и служил по несколько раз. Климент привлек к служению знакомых ему по Харбинской епархии клириков, которые, согласно отчётам уполномоченных Совета, выделялись среди остального духовенства высокой образованностью и были активными сторонниками начинаний епископа. Климент стремился добиться перевода в свои епархии других реэмигрантов из Китая, молодых и энергичных священнослужителей из разных епархий РПЦ, но в большинстве случаев этому препятствовали гражданские власти. Нехватку приходского духовенства Климент пытался преодолевать с помощью приобщения к церковному служению молодёжи, давал своим иподиаконам рекомендации для поступления в духовную семинарию. Архиерей рукополагал семинаристов, иногда первокурсников, во диаконов и посылал их на приходы. Одной из главных проблем, с которой столкнулся Климент, было крайне недостаточное количество церквей. В таких крупных городах, как Свердловск и Челябинск, было по одному действующему храму. Всего в Свердловской епархии в это время насчитывался 31 приход (21 в Свердловской области и десять в Курганской), в Челябинской епархии – 15 приходов. Климент неоднократно поднимал во время встреч с уполномоченным по Свердловской области вопросы открытия ещё одной церкви в Свердловске, кроме имевшегося собора, церкви в городе Камышлове, крестильной комнаты при церкви в Красноуфимске; обсуждались также вопросы о разрешении колокольного звона в действующих приходах и об увеличении окладов некоторым священникам.