В 1811 г. настоятель лавры преподобного Давида архимандрит Иларион (Бебуришвили) начал обновление Преображенской церкви, в которой находилась могила святого. Во время работ было решено расширить свод, под которым помещалась рака с мощами. Когда разобрали один из столпов алтарной преграды, была найдена стена с иконой преподобного Давида и его ученика преподобного Додо Гареджийского; когда убрали и её, «обнаружили другую, тоже оштукатуренную, с небольшой полкой внутри; а за той полкой – маленькое отверстие, в котором был спрятан драгоценный Камень... На нём сохранились следы от свечей, выцветшие от древности». Как пишет очевидец событий архимандрит Тарасий (Алекси-Месхишвили), братия «по примеру своих предшественников» для безопасности поместила Камень благодати в тайник в той же церкви, «известный лишь старейшим монахам, и только во время церковных праздников достают его для поклонения, а затем убирают обратно в тайник». В середине XIX в. Камень благодати хранился в маленькой серебряной дарохранительнице под трапезной Преображенской церковью. Андрей Николаевич Муравьёв видел его на могиле преподобного Давида. 18 июля 1851 г., во время нашествия лезгин, лавра преподобного Давида была разорена, но Преображенская церковь, где находилась могила преподобного Давида, которую нападавшие так и не нашли, уцелела. 1 октября могила преподобного Давида всё же была обнаружена, и вместе с другими сокровищами монастыря лезгины унесли и Камень благодати. Во время дележа награбленного Камень благодати, назначение которого они не знали, спрятали на чердаке одного из домов. За святыней следил взятый в плен иеромонах Митрофан (Нацвлишвили). Спустя год он был освобождён из плена, тайно вынес Камень благодати и вернул его в лавру. В конце XIX в. Камень благодати, по сведениям епископа Кириона (Садзаглишвили; впоследствии католикос-патриарх всей Грузии Кирион III), хранился на могиле преподобного Давида. В это же время иеромонах Каллистрат (Чичуа) отмечал, что «этот камень и могилу святого Давида уважают и уповают на них грузины, русские и армяне». После установления советской власти в Грузии и приостановления монастырской жизни в Гареджи Камень благодати в 1923 г. вместе с другими святынями был перевезён в Тифлис и помещён в сокровищницу Государственного музея искусств Грузии. В 1990 г. его передали Грузинской православной церкви. В настоящее время Камень благодати хранится в алтаре патриаршего кафедрального собора Самеба (Святой Троицы) в Тбилиси. В 2000 г. по благословению католикоса-патриарха всей Грузии Илии II (Гудушаури-Шиолашвили) в церкви Преображения Господня в лавре преподобного Давида была отреставрирована могила преподобного Давида Гареджийского. В могильной плите сделали небольшое отверстие, куда поместили копию святыни.