В годы советской власти происходили большие гонения на церковь, государство вело активную антирелигиозную пропаганду. В 1922 г. ведущую к храму улицу Церковную переименовали в улицу Лермонтова. В конце августа 1935 г. Ильинскую церковь закрыли для верующих, а само культовое здание стали использовать для хранения областного архива, и разместили внутри него большое количество стеллажей. Следующие полвека храм стоял без крестов и постепенно ветшал. Существовавшие в нём настенные росписи осыпались, потолок со временем почернел, а стены во многих местах покрылись плесенью. В годы Великой Отечественной войны бывшие прихожане обращались к городским властям с просьбой об открытии храма, но их просьбы так и остались безответными. Вернуться в церковь верующие смогли только в 1989 г. С этого времени здесь начались большие ремонтно-восстановительные работы. Средствами и материалами Ильинской церкви помогали анонимные жертвователи, а также ивановские предприятия – Меланжевый и Мебельный комбинаты, Лежневское домостроительное управление, городской ЗАГС и др. Храм стал быстро преображаться. Первую литургию в начале 1990 г. прихожане провели в подвальном помещении, в котором теперь обустроен цокольный крестильный храм, а к середине лета того же года богослужения совершались уже в самой церкви. В ходе ремонтных работ освободили от кирпичной кладки окна, отштукатурили и покрасили стены, подновили настенные росписи, и к 1993 г. храм был полностью восстановлен. Ильинский храм был построен на фундаменте из белого камня в традициях архитектуры позднего классицизма, отличается оригинальной объёмной композицией. Считается, что авторство проекта церкви принадлежит губернскому архитектору Евграфу Яковлевичу Петрову (1786–1839 гг.). Основной объём здания представляет собой куб, поверх которого стоит цилиндрическая световая ротонда, покрытая куполом в виде полусферы. На нём, на цилиндрических барабанах установлены пять луковичных глав. С запада к церковной трапезной примыкает относительно невысокая колокольня, верхний ярус которой также выполнен в виде цилиндра. Приниженные размеры колокольни, трапезной и прямоугольной алтарной абсиды только подчёркивают доминирующее положение и величие главного здания храма. Северный и южный входы в храм декорированы строгими портиками с четырьмя колонами. Стройная ротонда украшена световыми и ложными арочными окнами. А оконные проёмы на трапезной и основном объёме храма декорируют аккуратные треугольные фронтончики. Снаружи алтарной абсиды размещено цветное мозаичное панно, изображающее Воскресение Христово. Своды и стены внутри храма имеют настенную роспись с библейскими сюжетами. Также в этой церкви отчасти сохранились старые мозаичные полы. Ильинский храм – действующий, и богослужения в нём совершаются ежедневно. Для детей прихожан здесь работает воскресная школа, а в летнее время проводятся лагеря. В храме также создана библиотека православной литературы. В церкви есть четыре престола. Главный освятили в честь Илии Пророка в январе 1990 г. Престол в левом приделе посвящён Рождеству Богородицы (2001 г.), в правом – Сорока мученикам Севастийским. Ещё один престол размещён в цокольном крестильном храме, посвящён Иоанну Кронштадтскому, его освящение прошло в 2004 г. Престольные праздники в Ильинской церкви отмечают 22 марта, 2 августа и 21 сентября. Храмовыми святынями считаются старинные иконы Николая Чудотворца и Божьей Матери «Казанская», написанные в XVII в., а также два ковчега с частицами мощей христианских святых.