В 1939–1940 гг. Иоанн пребывал близ Мёртвого моря в пещере в Кумране вместе с монахом Иоанникием (Пырыялой), который стал верным учеником святого и сопровождал его до конца его жизненного пути. В 1940–1941 гг., во время Второй мировой войны, Иоанн был интернирован английскими властями Палестины в лагере, устроенном на Елеонской (Масличной) горе, затем вернулся в монастырь cв. Саввы. 13 мая 1947 г. в храме Гроба Господня в Иерусалиме Иоанн был рукоположён во диакона, 14 сентября – во священника и назначен настоятелем румынского скита cв. Иоанна Предтечи на Иордане. В скиту Иоанн отстроил кельи для монахов и гостиницу для паломников. В 1952 г. Иоанн вместе с монахом Иоанникием перешёл в монастырь преподобного Георгия Хозевита. В следующем году Иоанн удалился в скит св. Анны, расположенный в 3 км от монастыря и представлявший собой пещеру. В первой её части (12 кв. м), в стене которой была ниша, служившая престолом, Иоанн молился и недолго отдыхал на рогоже, расстеленной на доске, писал духовные стихи. Во второй части пещеры (6 кв. м), соединённой с первой лазом, он вкушал хлеб и воду, которые ему приносили из монастыря. В третьем помещении («пещере почивших») находились останки тех, кто подвизались здесь прежде. Большую часть дня и ночи Иоанн проводил в молитвенном бдении, совершал полное монашеское правило. По большим церковным праздникам служил в монастырском храме преподобного Георгия Хозевита. Иоанн был погребён в пещере. Ученик старца монах Иоанникий (Пырыяла) издал в 1968 г. в Иерусалиме стихотворения, переводы и поучения Иоанна в двух томах под названием «Пища духовная» с предисловием архиепископа Аристовула (Иерусалимский патриархат). В августе 1980 г. совет старцев монастыря открыл «пещеру почивших» и обрёл останки Иоанна нетленными. Иерусалимский патриарх Венедикт разрешил перенести мощи святого в монастырский храм. Священный Синод Румынской православной церкви, приняв во внимание все собранные к тому времени свидетельства святости нового подвижника, 20 июня 1992 г. постановил причислить Иоанна к лику святых. В том же году митрополит Назарета Кириак (Иерусалимский патриархат) передал Митрополии Молдовы частицу мощей Иоанна, которая была положена в кафедральном соборе города Яссы.