Одновременно являлся членом миссионерского совета Грузинского экзархата (1915–1917 гг.), членом комиссии по устройству курсов пчеловодства для духовенства и учителей церковноприходских школ Экзархата (1916 г.). В 1917 г. стал редактором журнала «Вестник Кавказского Экзархата». Член русского Закавказского церковного Собора 25–29 мая 1917 г. После неканоничного провозглашения автокефалии Грузинской церкви Иосиф был членом согласительной комиссии по переговорам с Грузинской православной церковью. Состоял членом исполнительного комитета русского духовенства и мирян Кавказского экзархата (1917–1919 гг.). В ноябре 1917 г. стал ректором Тифлисской духовной семинарии и членом Кавказской синодальной конторы. В 1919–1920 гг. – постоянный представитель от Кавказской синодальной конторы в Закавказском русском национальном совете. В 1920–1921 гг. – временно председательствующий в Кавказской синодальной конторе. В 1921 г. в связи с ликвидацией всех учреждений и учебных заведений Русской церкви в пределах Грузинской республики вернулся во Владикавказ. В 1922 г. уклонился в обновленчество, был настоятелем владикавказского Спасо-Преображенского собора. В 1922–1924 гг. член обновленческого Владикавказского епархиального управления, в 1922 г. – его председатель. В 1922–1926 гг. – депутат епархиальных съездов духовенства и мирян обновленческой Владикавказской епархии. В 1928–1934 гг. – член Благовестнического отдела при Владикавказском епархиальном управлении. В 1932 г. состоял членом юбилейной комиссии по ознаменованию десятилетия обновленческого движения. 25 марта 1934 г. возведён в обновленческом расколе в сан протопресвитера, награждён митрой. В ноябре 1935 г., после закрытия Спасо-Преображенского собора, служил в церкви Михаила Архангела в Грозном. С 29 марта 1941 г. состоял за штатом, проживал у дочери в том же городе. 10 ноября 1942 г. вернулся к служению в грозненской церкви Михаила Архангела. Принёс покаяние и был принят в РПЦ. 7 сентября 1945 г. наречён и 9 сентября хиротонисан во епископа Воронежского и Острогожского. Хиротонию в московском Петропавловском храме возглавил патриарх Алексий I. Одним из первых дел в архиерейском служении Иосифа стала организация шести благочиннических округов (впоследствии был организован седьмой округ). Из 85 районов Воронежской области 26 не имели действующих храмов. Поэтому, управляя епархией, Иосиф стремился к открытию новых приходов и храмов, что негативно воспринималось уполномоченным Совета по делам РПЦ и отмечалось в его отчётах. За 1945 г. в епархии было открыто 19 приходов. С 1945 г. Иосиф пытался вернуть епархии здание Покровской церкви, отданное краеведческому музею, где находились как экспонат мощи Митрофана Воронежского. Иосиф безуспешно добивался их передачи церкви (состоялась только в сентябре 1989 г.).