Лишь в конце 1820 гг. комиссией, составленной из сотрудников Министерства духовных дел и народного просвещения и Генеральной консистории, был разработан новый устав Евангелическо-Лютеранской церкви в России. 28 декабря 1832 г. он был утверждён императором Николаем I и стал законом, закрепившим включение управления протестантскими церквями в систему государственно-административного управления. Этим уставом определялся штат и полномочия нового коллегиального органа церковно-административного управления – Генеральной евангелическо-лютеранской консистории, которой передавались функции упразднённой Юстиц-колегии Лифляндских и Эстляндских дел. В составе Генеральной консистории, подчинявшейся через посредство министра внутренних дел императору, было и так называемое «Особое заседание» для реформатских общин. Все лютеранские общины объединялись в единую церковь. Вся территория Российской империи была разделена на восемь консисториальных округов, шесть из которых располагались в Остзейских провинциях, а остальные два (Петербургский и Московский) охватывали практически всю империю: первый – запад Европейской части России и Украину, а второй – территорию от Москвы до Тихого океана. Генеральная консистория имела светского президента (с 1833 по 1845 гг. – граф Павел фон Тизенгаузен) и духовного вице-президента (с 1832 по 1840 гг. – Иоганн Фридрих Август Фольборт). Обновлённая Генеральная консистория состояла, в свою очередь, из двух консисторий, находившихся в Москве и Санкт-Петербурге. Все дела решались на общих заседаниях Генеральной консистории (так называемых юридиках), которые проходили дважды в год. Кроме того, при Генеральной консистории была учреждена должность прокурора. «Закон о Евангелическо-Лютеранской церкви в России» дал российским лютеранам единые правовые основы существования и общие богослужебные правила. Новый закон обеспечивал лютеранской церкви государственную поддержку, а также способствовал развитию форм солидарной поддержки со стороны сильных общин слабым. Он дал мощный толчок в строительстве церковных зданий, образовательных и благотворительных учреждений лютеран. В этом же направлении действовала основанная в 1859 г. «Вспомогательная касса для Евангелическо-лютеранских общин в России», которая также обеспечивала жалованье и пенсии духовенству и их семьям в отдалённых и бедных общинах.