27 июля 1925 г. посетил заседание расширенного пленума обновленческого Томского епархиального управления, но уклонился от ответа на вопрос об участии в подготовке к Собору. 28 августа Димитрий прибыл на епархиальный съезд обновленцев, где выразил несогласие с постановлениями обновленческого собора 1923 г. и предложил немедленно поставить вопрос о примирении с патриаршей церковью. Услышав, что прежде нужно обсудить участие архиерея в новом обновленческом Соборе, на котором будет решаться этот вопрос, Димитрий покинул съезд. После образования в декабре 1925 г. Временного Высшего Церковного Совета (ВВЦС), самочинно объявившего себя высшим органом церковного управления, Заместитель Патриаршего Местоблюстителя митрополит Сергий (Страгородский; в 1943–1944 гг. – Патриарх Московский и всея Руси) запретил в священнослужении предводителя григорианского раскола Свердловского архиепископа Григория (Яцковского) и других организаторов ВВЦС. Пытаясь обосновать каноничность своих действий, члены ВВЦС обратились к находившемуся в заключении Патриаршему Местоблюстителю митрополиту Петру (Полянскому). Не осведомлённый о ходе церковных дел митрополит Пётр резолюцией на докладе ВВЦС от 1 февраля 1926 г. передал свои полномочия коллегии в составе Владимирского архиепископа Николая (Добронравова), Димитрия и архиепископа Григория, о запрещении которого Местоблюститель не знал. Митрополит Пётр также не знал, что другие члены назначенной им коллегии не имеют возможности принять участие в её работе. Архиепископ Николай пребывал под арестом. Димитрий был арестован 6 февраля и 23 февраля освобождён без права покидать Томск. 22 апреля того же года митрополит Пётр подтвердил полномочия своего заместителя митрополита Сергия, а 9 июня издал резолюцию об упразднении ранее учреждённой коллегии. В противостоянии Заместителя Патриаршего Местоблюстителя митрополита Сергия и ВВЦС Димитрий придерживался двойственной позиции. Исследователям известно, что он распорядился распространить в епархии доклад епархиального делегата о беседе с митрополитом Сергием и тексты посланий епископов, признавших ВВЦС. В октябре 1926 г. Димитрий дал подтверждение верности митрополиту Сергию прибывшему для этого в Томск Нижнеудинскому епископу Евсевию (Рождественскому). В связи с проведёнными ОГПУ в ноябре-декабре того же года массовыми арестами архиереев, в том числе митрополита Сергия, связь между православными епархиями была затруднена; клир и паства пребывали в недоумении, кого следует считать носителем высшей канонической власти в церкви. В феврале 1927 г. участники съезда духовенства и мирян в Барнауле обратились к Димитрию с вопросом: кто является в настоящее время высшей церковной властью? Димитрий ответил, что не знает.