В Смутное время Тихвин был занят шведами. 14 сентября 1613 г., во время восстания горожан и окрестных крестьян против шведского гарнизона, Введенский монастырь был разорён и сожжён. Насельницы, в том числе Дария, бежали из города. По преданию, они скрывались в лесу на берегу озера, которое позднее стало называться Царицыным. Среди документов Новгородской приказной избы 1611–1617 гг., находящихся в Государственном архиве Швеции в Стокгольме, хранится выписка, относящаяся к времени шведской оккупации Тихвина, о размере и формах «жалования» на содержание Дарии (выписка была подана в новгородскую администрацию по неустановленному поводу, сопутствующие документы отсутствуют). Из выписки явствует, что средства выделялись нерегулярно и не в полном объёме. Вскоре местом жительства Дарии стал город Устюжна-Железнопольская, располагающийся на полпути между Тихвином и Горицким монастырём. Дарию и бывших с ней стариц поселили в «двух кельишках... черного попа» Геннадия при Рождественском городском соборе, а духовника царицы-инокини – в отдалении, где жили дети боярские, стрельцы и другие мирские люди. По царской грамоте Дария получала «царское жалование годовое – деньги и запасы... из устюженских ис таможенных и ис кабацких доходов, что останетца от пищалей и от стрельцов». Михаил Фёдорович Романов грамотой от 26 августа 1614 г. предоставил в распоряжение Дарии вотчину – село Никифорово Устюженского уезда с деревнями и пустошами – взамен изъятого у царицы-инокини сельца Никольского (грамота была подтверждена 28 марта 1616 г., 4 июля 1621 г.: «Акты исторические», том 3). В январе 1624 г. Дария вернулась в Тихвин; как полагают исследователи, стала игуменьей Введенского монастыря, как о том свидетельствует жалованная грамота обители царя Михаила Фёдоровича Романова на пустошь Бурково в Тихвинском погосте Новгородского уезда («Акты исторические», том 3). Михаил Фёдорович Романов не только жаловал Дарии земельные угодья, но и посылал царице-инокине дары. В мае 1623 г. ей были пожалованы серебряная позолоченная братина с чаркой, по 10 аршин бархата и камки, сорок соболей и 100 руб. (Российский государственный архив древних актов, Оружейная палата). В конце сентября 1624 г. Д. Колтовский (по мнению исследователей, родственник царицы-инокини) привёз ей дары со свадьбы Михаила Фёдоровича Романова и Марии Владимировны Долгорукой. В феврале 1626 г. другой родственник Дарии, князь Д. Гагарин, привёз ей дары со свадьбы Михаила Фёдоровича Романова и Евдокии Лукьяновны Стрешневой. В это время вместе с Дарией во Введенском монастыре жили её племянницы княжны-монахини Леонида Григорьевна и Александра Григорьевна Гагарины. Перед смертью Дария приняла схиму. Своей «изустной памятью», засвидетельствованной духовным отцом старицы иеромонахом Феогностом, Дария передала принадлежавшие ей село Никифорово с деревнями и рыбную ловлю на реке Волхов Введенскому монастырю: «игуменье Огафье с сестрами и кто по ним в том монастыре иная игуменья и сестры будут».