После предоставления существенной автономии ирландскому парламенту (1782 г.) для защиты британских политических интересов был основан Орден св. Патрикия (1783 г.). Протестантский архиепископ Дублина автоматически становился канцлером Ордена, декан собора – секретарём. Капеллой Ордена служил собор св. Патрикия в Дублине; в 1792 г. собор был временно закрыт из-за ветхости; к 1805 г. часть храма обрушилась. Усиление позиций католической иерархии обеспокоило англиканское духовенство. Архиепископ Уильям Маги (1822–1831 гг.) был известен конфликтами с католическим духовенством, по его приказу для католиков закрывались протестантские кладбища, и запрещалось совершение католического богослужения на руинах монастыря Глендалох в день памяти преподобного Коэмгена (Кевина). В 1849 г. была основана Ирландская церковная миссия, деятельность которой была направлена на проповедь среди католиков («Вторая Реформация»). Миссионеры проповедовали преимущественно в западных частях острова, однако штаб-квартира миссии находилась в Дублине. Архиепископ Ричард Уэйтли (1831–1863 гг.) сотрудничал с католическими иерархами в деле учреждения сети начальных школ в Ирландии, надеясь, что просвещение заставит католиков отказаться от своей веры. Также архиепископ участвовал в работе правительственных комиссий по национальной системе образования и бедности в Ирландии, выделил значительные средства для помощи голодающим во время Великого голода (1845–1849 гг.). В первой половине XIX в. в Ирландии наблюдался упадок Англиканской церкви. В 1838 г. церковная провинция Кашела была упразднена и присоединена к Дублину, в 1846 г. то же произошло с протестантским епископством Килдэр. Несмотря на малочисленность, церковь Ирландии (к ней принадлежало меньшинство населения) сохраняла государственный статус. Все жители Ирландии были обязаны платить десятину для содержания англиканского духовенства, что вызывало возмущение католиков («Десятинная война», 1831–1836 гг.). В 1869 г. был издан закон, согласно которому с 1871 г. Англиканская церковь Ирландии теряла государственный статус (disestablishment), а десятина отменялась. Ряд церковных владений был передан государству, вместо них духовенству выплачивалась денежная компенсация. Закон вызвал неоднозначную реакцию со стороны представителей церкви Ирландии, большинство которых было обеспокоено грозившим финансовым кризисом. В 1868 г. в соборе св. Патрикия состоялось совещание епископов провинций Арма и Дублина. Для преодоления ожидаемых финансовых трудностей при Генеральном синоде был создан Представительный церковный совет (Representative Church Body). Собор св. Патрикия был провозглашён национальным собором церкви Ирландии, пребендариями которого стали представители всех епископств. Собор Святой Троицы стал кафедральным храмом объединённого англиканского архиепископства Дублин, Глендалох и Килдэр (1872 г.). Архиепископ У. Конингем (1884–1897 гг.) поддерживал Ирландскую церковную миссию и развивал отношения с протестантскими организациями в Испании, Португалии и Италии; также выступал с позиций евангеликов за ревизию «Книги общих молитв». Архиепископ Дж. Г. Бернард (1915–1919 гг.), президент Королевской ирландской академии (с 1916 г.) и ректор Тринити-колледжа (с 1919 г.), известен как богослов и философ. В 1898 г. вместе с профессором Р. Аткинсоном он издал «Книгу гимнов», один из источников по истории церкви в кельтской Ирландии. После получения в 1921 г. Ирландией статуса самоуправляемого доминиона (Ирландское свободное государство) положение Англиканской церкви ухудшилось. К 1922 г. протестанты составляли 7,4% населения страны.