Красногорский Богородицкий, на реке Пинеге (мужской, основан в 1603 г., закрыт в 1920–1922 гг.); Ущельская мужская пустынь, в селе Ущелье на реке Мезени (основана до 1608 г. Иовом Ущельским, упразднена до 1764 г., возобновлена в ноябре 1901 г. как женская община во имя Иова Многострадального, в декабре 1908 преобразована в монастырь, закрыт в 1920–1922 гг.); Лявленский в честь Успения Пресвятой Богородицы, при впадении реки Лявли в Северную Двину (мужской, упоминается с 1610 г., в 1764 г. упразднён); Верхошеремская Вознесенская мужская пустынь, в верховьях реки Шереньги (основана до 1613 г., в 1764 г. упразднена); Ламбасская Преображенская мужская пустынь (основана в 1615 г., в 1777 г. преобразована в приход); Козьеручьёвский Спасский, на правом берегу Северной Двины (мужской, основан в 1617 г. на месте явления образа Спасителя, в 1764 г. преобразован в приход); Пертоминский, на мысе Красногорский Рог в Белом море (мужской, основан в 1617 г. на месте обретения мощей преподобных Вассиана и Ионы Пертоминских, в 1764 г. упразднён, в 1778 г. возобновлён, закрыт в 1920–1922 гг.); Кривецкий, на левом берегу Северной Двины (мужской, основан до 1619 г., в 1764 г. упразднён); шенкурский Троицкий (основан в 1637 г. как мужской, приблизительно с 1665 г. женский, в 1764 г. преобразован в приход, в 1779 г. возобновлён как мужской, в 1865 г. вновь преобразован в женский, закрыт в 1920–1922 гг.); Уздринская (Узринская) Введенская мужская пустынь, на реках Уздре и Пуе (основана до 1646 г., в 1764 г. упразднена); Верхопаденская во имя Николая Чудотворца мужская пустынь, на левом берегу реки Паденьги (основана в 1656 г. на месте явления чудотворной иконы святителя Николая (1620 г.), в 1764 г. упразднена); Кий-Островский в честь Воздвижения Животворящего Креста Господня, на острове Кий Онежского залива (мужской, основан в 1656 г., закрыт в 1920–1922 гг.); Макариевская Предтечева мужская пустынь, на озере Юмзенском (основана в 1667 г., в 1779 г. преобразована в приход); Холмогорский Владимирский (женский, основан до 1672 г., упразднён в 1687 г.); Холмогорский Успенский (женский, учреждён в 1688 г. взамен упразднённого Владимирского монастыря, до 1798 г. назывался Успенский на Курцове, в 1786 г. издан указ об упразднении монастыря, который не был исполнен, закрыт в 1920–1922 гг.); Сёмженские кельи, женский скит около реки Сёмжи (основан во второй половине XVII в. старообрядческими инокинями Евфимией и Павлой, до начала XX в. старообрядческий, в начале XX в. заселён православными монахинями, в 1901 г. приписан к Ущельской общине); Новоземельский Николаевский мужской скит Корельского монастыря, на острове Новая Земля (основан в 1882 г., закрыт в 1920–1922 гг.); Святоезерский Николаевский мужской скит Артемиева Веркольского монастыря, на берегу Святого озера (основан в 1885 г., закрыт в 1920–1922 гг.); Николаевский мужской скит, на Югорском Шаре, приписной к Артемиеву Веркольскому монастырю (основан в 1890 г., к 1893 г. насельники погибли от цинги); Сурский во имя святого апостола Иоанна Богослова, в селе Сура Пинежского района (женский, основан Иоанном Кронштадтским в 1899 г. как женская община, закрыт в 1920–1922 гг., возрождён постановление Священного Синода от 4 октября 2012 г.); Ямецкий, в Онежском уезде (учреждён в августе 1908 г. как женская община, закрыт в 1920–1922 гг.).