Исторические сведения об этом регионе появляются с XIV в. до н.э. В амарнских письмах, адресованных египетскому фараону и высоким египетским чиновникам, упоминаются военные конфликты из-за центральной части Голанских высот. Некоторые из поселений на Голанских высотах, известных из египетских памятников, идентифицированы (Мааха, Гессур). Дискуссионным остаётся вопрос, в какой мере библейские книги Иисуса Навина, Царств и Паралипоменон могут осветить историю этого региона. Во всяком случае, в X–VIII вв. до н.э. между арамеями и евреями, потом между Израилем и Дамаском велась непрекращающаяся борьба за контроль над ним (Нав. 12:5; 2 Цар. 10:6–19; 3 Цар. 9:18; 15:20; 20:1–43; 4 Цар. 10:32–33; 14:25; 1 Пар. 2:23). В 733 г. до н.э. Голанские высоты были присоединены к Ассирии (4 Цар. 15:29). В раннюю эллинистическую эпоху территория Голанских высот была независимой административной единицей (ипархией). Селевкиды включили её в состав более крупной провинции Гилеад, но в результате Маккавейской войны она частично перешла под власть Хасмонеев. В 83–80 гг. до н.э. Александр Яннай овладел большей частью Голанских высот. В 64 г. до н.э. Гней Помпей передал их правителю Итуреи Птолемею, сыну Меннея. В 20 г. до н.э. император Август отдал территорию царю Ироду, после смерти которого в 4 г. до н.э. она перешла под власть тетрарха Филиппа. При нём столицей стала Кесария Филиппова. Поскольку Филипп не оставил наследников, после его смерти в 34 г. н.э. территория была включена в состав провинции Сирии, в 37 г. дарована императором Калигулой царю Агриппе I, а в 53 г. – Агриппе II. Регион сильно пострадал в период первой войны с Римом (66–70 гг.). После смерти Агриппы II часть территорий отошла Сирии, часть – Иудее. В эпоху поздней Римской империи регион процветал. В VII в. Голанские высоты оказались под властью арабов, однако еврейские общины существовали в регионе до XIII в. Голанские высоты вновь обрели статус административной единицы только в 1880 гг. в составе Османской империи, когда центром региона стала Эль-Кунейтра. С начала XX в. на её территорию стали проникать еврейские поселенцы, но до 1967 г. там жили, в основном, мусульмане-сунниты, а также друзы и другие национальные меньшинства. В результате так называемой шестидневной войны между Израилем и соседними арабскими государствами в 1967 г. Голанские высоты были оккупированы израильскими войсками и вошли в состав государства Израиль.