Енох узнаёт от Бога о семи тысячах лет существования мира и восьмом тысячелетии в конце истории, а также о наказании идолопоклонников в водах потопа и о праведнике из рода Еноха, от которого произойдёт новое поколение людей. После этого Еноху позволено вернуться на землю, чтобы в течение 30 дней дать наставление своим потомкам. После возвращения Енох отдаёт своим детям написанные книги и рассказывает им о том, что увидел на небесах, об обетованиях Бога людям и о Его ожиданиях от них, а также о дне Суда. Затем он даёт благословение и наставление Мафусалу, его братьям с семьями и старейшинам народа, после чего вновь возносится на небеса. Далее следует описание жизни Еноха и его дел, а также рассказ о строительстве Мафусалом и его братьями алтаря в Ахузане – на месте вознесения Еноха. В последних главах книги подробно рассказывается о священническом служении сына Еноха Мафусала, перед смертью передавшего служение Ниру, второму после Ноя сыну Ламеха. Мафусалу даётся откровение о грядущем гневе Господа на грешников и о потопе, а также о новом человечестве от семени Ноя, которое будет существовать до времени, пока вновь не согрешит перед Богом. Затем следует рассказ о похоронах Мафусала в Ахузане, о жизни Нира, а также о чудесном зачатии и рождении Мелхиседека и его взятии на небеса. Книга заканчивается рассказом о Ное, которому даётся заповедь о построении ковчега, о потопе и о смерти Ноя в возрасте 950 лет. Для автора «Второй книги Еноха» Бог – единственный Творец и Господь всего сущего. В описываемой в книге небесной иерархии Он занимает седьмое небо и предстаёт в образе Царя, окружённого придворными. О Боге также говорится как о Судии мира. Автор «Второй книги Еноха» мало интересуется историей мира после потопа и эсхатологическими проблемами. Описанный во «Второй книге Еноха» процесс сотворения мира имеет характер эманации, что, как полагают исследователи, является результатом гностического или неоплатонического влияния, однако сам акт творения инициирован Божественной волей. Хотя сотворение земли приписывается Богу, оно имеет дуалистические черты: твердь разграничивает «вышний» и «дольний» миры, а всё, что находится ниже тверди, создано из преисподней. Земля же создана из воды: «...И от волн создал Я камни твёрдые и большие, и из камней собрал Я сушу и назвал её землёй». Ангельский мир создан на второй день творения: «...От камня высек Я сильный огонь и из огня создал Я чины бесплотного воинства, десять тысяч ангелов, и оружие их огненное и одежды их – пламень палящий». Один из архангелов, Сатанаил, вместе со своим чином отошёл от Бога и «возымел мысль неосуществимую поставить престол свой выше облаков над землёй и быть равным» Богу «по силе». Бог низверг падших ангелов, и Сатанаил стал называться «сатана». При этом изменилась не его природа, но образ мыслей. Узнав о том, что Бог хочет создать иной мир, в котором всё должно быть подчинено человеку, дьявол задумал прельстить человека. Первородный грех стал причиной смертности человека, его действие продолжается в потомках Адама.