После кончины 22 марта 1981 г. архиепископа Георгия (Тарасова) предстоятелем архиепископии русских приходов Западной Европы стал Евдокийский архиепископ Георгий (Вагнер; ум. 6 апреля 1993 г.), а затем Евкарпийский архиепископ Сергий (Коновалов). В мае 1995 г. в ходе паломничества архиепископа Сергия в Россию состоялось восстановление общения между Московским патриаршим престолом и архиепископией русских приходов в Западной Европе, 7 мая архиепископ Сергий сослужил Патриарху Московскому и всея Руси Алексию II на Божественной литургии в Успенском соборе Московского Кремля. 19 июня 1999 г. Константинопольский патриарх Варфоломей I издал томос, восстанавливающий за архиепископией русских приходов в Западной Европе статус патриаршего экзархата и упраздняющий формальную зависимость архиепископии от французского митрополита Константинопольского патриархата. Это решение можно было интерпретировать как желание Константинопольского престола подчеркнуть свою юрисдикцию над западноевропейскими русскими приходами. Оно было опротестовано священноначалием Московского патриархата. При экзархе архиепископе Сергии вновь был поставлен вопрос о возвращении западноевропейских русских приходов в каноническое подчинение Московскому патриархату. Под председательством архиепископа Сергия несколько лет действовала рабочая группа, которая в сотрудничестве с представителями Московского патриархата подготовила проект создания Западноевропейского митрополичьего округа, куда бы вошли приходы РПЦ, Западноевропейского экзархата и РПЦЗ. После кончины 22 января 2003 г. архиепископа Сергия по результатам выборов на общем собрании новым экзархом стал Команский архиепископ Гавриил (де Вильдер), который взял курс на отдаление от Московского патриархата. В настоящее время в составе экзархата насчитывается около 90 приходов и общин, в том числе больше 40 – на территории Франции (наибольшая православная епархия в этой стране). На территории Франции находится Покровский женский монастырь в Бюси-ан-От и Православный Свято-Сергиевский богословский институт в Париже. Отдельные приходы экзархата есть в Бельгии, Нидерландах, Германии, Испании, Италии и в Скандинавских странах. Приходы на территории Великобритании составляют Амфипольское викариатство во главе с епископом Василием (Осборном), который в 2006 г. перешёл из РПЦ в Константинопольский патриархат. Викарием экзархата также является Клавдиопольский епископ Михаил (Стороженко). Богослужение в приходах ведётся на церковнославянском и на западноевропейских языках. При экзархате издаётся «Епархиальный вестник Архиепископии православных русских церквей в Западной Европе» на русском и французском языках.