Большое значение в наследии В.В. Зверинского имеют его исследования монастырей в России. Интерес к истории отечественного монашества появился у него в 1860 гг. В переработанном В.В. Зверинским «Кратком учебном курсе географии Российской империи» Якова Павловича Кузнецова (СПб., 1885 г.) добавлены, в частности, сведения о монастырях, хотя дополнения не отличаются систематическим характером, а издание содержит многочисленные ошибки. Последним и наиболее важным трудом В.В. Зверинского, результатом 20-летней работы в свободное от службы время, стал «Материал для историко-топографического исследования о православных монастырях в Российской империи с библиографическим указателем» (СПб., 1890–1897 гг., три выпуска). В предисловии автор указывал на значение монастырей как центров «духовно-нравственного учения для народа» и «колонизации и ассимилизации инородцев», важность изучения обителей для истории Российского государства в целом. В числе своих основных задач В.В. Зверинский называл «приурочение географического положения монастыря», в том числе с помощью карт и материалов Центрального статистического комитета, установление времени основания или первого упоминания обители и современного состояния, включая связанную с ней топонимику. По мнению исследователей, решение этих задач составляет несомненную ценность его труда, особенно в отношении упраздненных обителей. Издание состоит из трёх разделов (томов): «Преобразование старых и учреждение новых монастырей с 1764-95 по 1 июля 1890 г.»; «Монастыри по штатам 1764, 1786 и 1795 гг.»; «Монастыри, закрытые до царствования императрицы Екатерины II». Сознавая уязвимость такой классификации, В.В. Зверинский сопроводил первый том дополнительным указателем, в котором преобразования монастырей сгруппированы в десять отделов по их характеру: «Восстановление обителей после их упразднения по штатам и учреждение новых на местах прежде существовавших» (в том числе бывших приписных, а также католических или униатских); «Обращение мужских обителей в женские»; «Основание новых монастырей, пустыней и скитов»; «Учреждение женских общин и принятие их в ведомство епархиального начальства»; «Преобразование женских общин в общежительные монастыри»; «Перенесение монастырей с одного места на другое»; «Обращение монастырей в архиерейские дома»; «Приписка обителей к архиерейским домам и другим монастырям»; «Упразднение обителей»; «Перемещение обителей из одной степени классов в другую».