В 1941 г. был помещён в немецкий лагерь для интернированных Фронтшталаг 122 (в Руайальё, пригороде Компьеня) из-за служебных связей с Великобританией и США, провёл в заключении несколько месяцев. Во время войны писал статьи и издавал «Вестник церковной жизни», единственный журнал во Франции, печатавшийся в эти годы на ротаторе. После окончания войны продолжал работу в Богословском институте. Участвовал в экуменических съездах – в Осло (1947 г.), Амстердаме (1948 г.), Торонто (1950 г.). Был членом содружества святого Албания и преподобного Сергия. В 1960 г. получил степень доктора (honoris causa) в Богословском институте и в том же году степень доктора богословия в университете Марбурга. Последние семь лет жизни Л.А. Зандер вёл в Богословском институте литургический семинар. Летом 1964 г. прочитал шестинедельный курс лекций о православии на богословском факультете Берлинского университета. Умер от сердечного приступа. Похоронен на кладбище Сент-Женевьев-де-Буа под Парижем. Его жена Валентина Александровна Зандер (урождённая Калашникова; 1894–1989 гг.) – православная духовная писательница, иконописец и церковный публицист. Работала вместе с Л.А. Зандером секретарём РСХД в Прибалтике, была секретарём Женских богословских курсов в Париже. Автор популярных книг: «О русских православных братствах» (1925 г., под фамилией Калашникова), «Les implications sociales de la doctrine de la Trinité» («Социальные последствия учения о Троице», 1936 г.), «La fête de l'Épiphanie» («Праздник Богоявления», 1947 г.), «La Pentecôte» («Пятидесятница», 1948 г.), «La fête de Noël» («Праздник Рождества», 1949 г.), «Преподобный Серафим Саровский» (1963 г.), «Христос – Новая Пасха: Богослужения Страстной седмицы и Пасхи» (Брюссель, 1964 г.) и ряда статей в журналах «Путь» («Икона Святой Троицы, 1931 г.), «Вестник РСХД» (в том числе о матери Марии (Скобцовой), 1955 г.), «Русское возрождение» («В обители преподобного Серафима», 1983 г., 2003 г.). Весной 1991 г. при содействии МИД Франции и протопресвитера Бориса Алексеевича Бобринского в библиотеку РАН (Санкт-Петербург) из Парижа была перевезена личная библиотека Л.А. Зандера (770 монографий, 300 ед. периодических изданий). 19 февраля 1993 г. в конференц-зале библиотеки РАН состоялся научно-теоретический семинар «Из истории отечественной книжной литературы», посвящённый памяти Л.А. Зандера. Его философско-богословское наследие представлено рядом книг и множеством статей. В статье «Русская религиозная философия и Православная Церковь», напечатанной уже после его смерти (1965 г.), Л.А. Зандер анализирует разные направления в русской философии по принципу отношения к религии. Из определения философии как «любви к мудрости» он делает вывод, что философ – тот, кто эту мудрость не только любит, но и ищет: «Для философов характерны голод и жажда – “духовная взволнованность”», по определению Николая Александровича Бердяева.