Первым епископом Инсбрука стал бывший глава администратуры Паулюс Руш (епископ в 1964–1980 гг.). В настоящее время в епископстве Инсбрук проживают около 530 тыс. человек, из них около 406 тыс. – католики; в Фельдкирхе – около 385 тыс., из которых католичество исповедуют около 264 тысяч. В соответствии с решением Тридентского собора (1545–1563 гг.) об организации новых учебных центров в 1617 г. в Зальцбурге была создана гимназия, ориентированная на преподавание теологии. Базой для неё послужила устроенная ещё архиепископом Арноном школа при соборе. В 1622 г. по решению архиепископа Париса Лондрона гимназии были дарованы привилегии, и выдано финансирование, необходимые для получения ей статуса университета. Зальцбургский университет славился теологическим и юридическим факультетами, сохранявшими традиционное преподавание, и профессорами-бенедиктинцами, во многом влиявшими на интеллектуальную жизнь университета. Утрата архиепископством Зальцбург независимости и присоединение его к Баварии сказались на судьбе университета. В 1810 г. он был распущен, вместо него создан теологический и философский лицей. В 1850 г. лицей вновь получил статус университета, но единственным действующим факультетом оставался теологический. После Первой мировой войны университет в Зальцбурге получил необходимую поддержку. В 1936–1937 гг. к открытию были готовы юридический и биологический факультеты, однако аннексия Австрии Германией помешала реализации этих проектов. В воссоздании католического университета после Второй мировой войны главную роль сыграли Зальцбургский архиепископ Андреас Рорахер (1943–1969 гг.) и глава земли Зальцбург Йозеф Клаус. 5 июля 1962 г. последовало решение об организации в Зальцбурге университета. Предполагалось, что сначала это будет лишь факультет католической теологии и философии (занятия начались в 1964 г.), затем добавятся факультет права и политических наук и медицинский факультет (1965 г., до 2002 г.). Современное разделение университета на четыре факультета (католической теологии, права, культуры и общественных наук, естествознания) – результат проведённой в 2002 г. реформы. Согласно переписи населения, проведённой в 2001 г., в Зальцбурге проживают больше 7,5 тыс. православных (более 14 тыс. на земле Зальцбург). Значительная часть верующих – потомки сербов, которые отказались после Второй мировой войны возвращаться в коммунистическую Югославию. С 1946 г. существует Зальцбургский приход СПЦ при храме св. Власия.