По данным на 1 января 1957 г., в Закарпатье насчитывалось 203 священнослужителя, два мужских монастыря и скит с 48 насельниками, четыре женских монастыря и шесть скитов с 295 монахинями. К осени 1961 г. продолжало функционировать лишь два монастыря. В конце 1960 гг. в Закарпатье было отмечено массовое уничтожение придорожных крестов с распятием. На 1 января 1982 г. в Мукачевско-Ужгородской епархии насчитывалось 417 храмов, 247 священнослужителей, семь благочиний, 135 насельниц в Мукачевской и Чумалевской обителях. 24 августа 1991 г. украинская Верховная Рада провозгласила независимость Украины. В рамках проходившего 1 декабря 1991 г. референдума свыше 92% жителей Закарпатья высказались за независимость Украины и 78% – за создание в Закарпатье самоуправляемой автономной территории. Поскольку последнее волеизъявление не было выполнено, результаты референдума служат важным аргументом для продолжения борьбы сторонников автономии Закарпатья в составе Украины. В начале 1990 гг. возобновились дискуссии о национальной принадлежности коренного восточнославянского населения Закарпатья, начали действовать русинские организации – Общество подкарпатских русинов, клуб «Рутения», Общество Кирилла и Мефодия, Сойм подкарпатских русинов, Народный совет русинов Закарпатья и др. Борьбу русинов за национальную идентичность и автономию Закарпатья в настоящее время возглавляет протоиерей УПЦ Димитрий Сидор. На волне перестройки в Закарпатье активизировались греко-католики, находившиеся до 1989 г. в подполье. На начало марта 1990 г. в местные органы власти были направлены документы на регистрацию около 50 греко-католических общин. На 1 января 1991 г. в Закарпатье было зарегистрировано 129 греко-католических общин. К августу 1990 г. конфликтные ситуации во взаимоотношениях между униатами и православными были отмечены в 97 населённых пунктах Закарпатья. В сентябре 1991 г. греко-католикам был передан ужгородский кафедральный собор (Мукачевская греко-католическая епархия подчиняется непосредственно Риму). Православная община выстроила новый Крестовоздвиженский кафедральный собор. Каноническое православие остаётся крупнейшей конфессией в Закарпатье. По данным на 1 января 1993 г., Мукачевско-Ужгородская епархия имела 459 общин, 11 монастырей с 301 насельником и насельницей, 315 священнослужителей. Решением Священного Синода УПЦ от 29 июля 1994 г. из Мукачевской епархии была выделена Хустская и Виноградская епархия. По данным на 1 января 1998 г., в Мукачевской епархии было 160 приходов, десять благочиний, 182 священника, шесть монастырей. Тогда же в Хустской епархии было 189 приходов, 15 благочиний, 228 священников (из них семь – кандидаты богословских наук), 11 монастырей. В 2001 г. УПЦ прославила в лике святых схиархимандрита Алексия (Кабалюка) как преподобноисповедника Алексия Карпаторусского. В крае есть небольшое количество сторонников УПЦ КП и УАПЦ. Румынское население Закарпатья представлено преимущественно православными, венгерское население – римо-католиками и реформатами. За последние десятилетия распространение в регионе получили иеговисты, пятидесятники и баптисты.