Император Иосиф II издал эдикт о веротерпимости (1781 г.), по которому всем исповедовавшим признанные в государстве религии (в первую очередь, протестантизм и греко-православие) гарантировалось право свободно отправлять культы и иметь свои церкви. Иосиф II отменил все постановления против евреев и приравнял их к гражданам государства. Но главным принципом его политики стало подчинение церкви авторитету государства. Все попытки папы Пия VI оспорить решения Иосифа II не увенчались успехом. Император Наполеон дважды (1805 и 1809 гг.) завоёвывал Вену. Эпоху наполеоновских войн завершил Венский конгресс (октябрь 1814 г. – июнь 1815 г.). В 1848 г. император Фердинанд отрёкся от престола, правителем стал Франц Иосиф I. В XIX – начале XX в. положение венской церкви почти не изменилось. В 1867 г. был признан гражданский брак и отменён конкордат с католической церковью 1855 г. Попытки либералов добиться отделения церкви от государства и религиозной свободы в тот момент не увенчались успехом. Эти требования австрийских либералов смогли быть реализованы только в 1918 г. После аншлюса Австрии (март 1938 г.) и оккупации Вены германскими войсками начались гонения на церковь. В 1945 г. в Вену вошли части Красной Армии. Город был поделён на четыре оккупационные зоны. 15 мая 1945 г. во дворце Бельведер между странами-победительницами и Австрией был подписан государственный договор, провозглашавший политический нейтралитет Австрии. В ходе Второй мировой войны погибло множество памятников архитектуры, в том числе практически полностью сгорел собор св. Стефана. Венский университет был основан герцогом Рудольфом IV Габсбургом и его братьями Альбрехтом III и Леопольдом III в 1365 г. по образцу Сорбонны. В июне того же года он был освящён папой Урбаном V. Согласно правилам, канцлером университета всегда становился священник собора св. Стефана. Первоначально в университете было три факультета: юридический, медицинский и свободных искусств (с XVI в. – философский); теологический факультет открылся в 1384 г. по распоряжению папы Урбана VI. В 1385 г. были выработаны университетские статуты. Герцог Альбрехт III пригласил профессоров из Праги и Парижа, организовал при университете корпорацию Collegium ducale в составе двух докторов теологии и 12 магистров свободных искусств, которые стояли во главе университета. Университетом управляли ректор, консистория и университетская ассамблея, в которую допускались только преподаватели. Студенты делились на «академические нации» (до 1849 г.): австрийскую (в том числе итальянцы и хорваты), рейнскую, венгерскую (в том числе славяне) и саксонскую (студенты из северогерманских государств, Скандинавии и Британских островов). Каждая академическая нация выбирала президента, или прокуратора, который наряду с деканами факультетов входил в консисторию и имел право участвовать в выборе ректора.