Введённый в заблуждение, митрополит Пётр согласился передать полномочия митрополита Сергия коллегии в составе трёх архиереев для временного управления церковью: Владимирского архиепископа Николая (Добронравова), Томского архиепископа Димитрия (Беликова) и Екатеринбургского архиепископа Григория. При этом от Патриаршего Местоблюстителя было скрыто, что архиепископы Николай и Димитрий не могут прибыть в Москву: первый находился под арестом, второй не имел разрешения на въезд в столицу. Таким образом, одобренная Местоблюстителем «коллегия» не могла быть создана, а полученная резолюция использовалась организаторами ВВЦС как «каноническое» обоснование своей деятельности. Архиепископ Григорий известил митрополита Сергия телеграммой о том, что его полномочия прекращены. Митрополит Сергий понял, что Патриарший Местоблюститель был введён в заблуждение, и отказался сложить с себя полномочия Заместителя Патриаршего Местоблюстителя. Своё отрицательное отношение к григорианскому расколу также выразили ряд православных архиереев, которые одобрили действия митрополита Сергия. Некоторые архиереи, присоединившиеся к ВВЦС, принесли покаяние митрополиту Сергию. Добившись возможности приехать в Москву (под надзором), митрополит Сергий 18 марта 1926 г. письмом уведомил митрополита Петра о современной церковной жизни и действиях григорианских раскольников. В тексте резолюции на это письмо, подписанном митрополитом Петром в апреле 1926 г., Патриарший Местоблюститель упразднил ВВЦС и подтвердил законность всех действий Заместителя Патриаршего Местоблюстителя и его полномочия. 18 апреля 1926 г., после встречи с Евгением Александровичем Тучковым, находившийся в ссылке в Перми Ярославский митрополит Агафангел (Преображенский), введённый в заблуждение относительно состояния церковных дел, обратился с посланием к всероссийской пастве и объявил, что он, согласно завещанию патриарха Тихона, вступает в права Патриаршего Местоблюстителя. В начале июня 1926 г. открылся съезд, призванный выработать позицию ВВЦС в сложившейся ситуации. ВВЦС считал себя коллегиальным органом при Патриаршем Местоблюстителе, но митрополит Агафангел ради церковного мира отказался от своих полномочий. 9 июня 1926 г. митрополит Пётр из заключения издал резолюцию о роспуске коллегии из трёх архиереев и подтвердил наложенные митрополитом Сергием запрещения на архиепископа Григория и единомысленных с ним архиереев. После этого ВВЦС утратил даже видимость каноничности существования, что привело к уменьшению его сторонников. Ещё в мае 1926 г. митрополиту Сергию принесли покаяние епископы Симеон (Михайлов) и Ириней (Шульмин), в июне – архиепископ Владимир (Соколовский-Автономов), епископы Мелхиседек (Паевский), Тихон (Русинов), Вассиан (Пятницкий) и Виссарион (Зорнин). В составе ВВЦС остались семь иерархов. Было собрано экстренное совещание, на котором приняли решение склонить на свою сторону митрополита Агафангела, однако он отказался поддержать григорьевцев. Весной 1927 г. митрополит Сергий (арестованный в ноябре 1926 г.) был освобождён из заключения, он и начал вести переговоры с властями о легализации возглавляемой им церкви и об учреждении при нём Временного Священного Синода.