Во исполнение постановления Священного Синода и Высшего Церковного Совета от 23 июня 1919 г. об увеличении числа епископов РПЦ в 1920–1930 гг. в епархии действовали три викариатства: Камчатское и Петропавловское, Никольско-Уссурийское и Охотское. 29 ноября 1917 г. владивостокский совет рабочих, крестьянских и солдатских депутатов взял власть в свои руки и признал СНК РСФСР. В апреле 1918 г. во Владивостоке высадился японский и английский десант, в конце апреля – начале июня того же года в город прибыли эшелоны чехословацских войск, в июне власть советов была свергнута. В декабре 1918 г. управление Владивостокской епархией принял бывший викарий Казанской епархии Чебоксарский епископ Михаил (Богданов), в 1918 г. уехавший из Казани. В 1918–1922 гг. продолжилась работа епархиального совета, благочиний, приходов, действовали монастыри. В марте 1920 г. в районе Морского кладбища Владивостока игуменья Руфина (Кокорева) организовала женскую общину в честь Смоленской иконы Пресвятой Богородицы «Одигитрия». Весной 1920 г. началось строительство обители, в 1921 г. в ведение общины было передано Морское кладбище. В учебных заведениях возобновилось преподавание Закона Божия. В июле 1922 г. во Владивостоке проходил Приамурский земский собор, в котором участвовали восемь делегатов от духовенства и 24 – от приходов Приморья; по одним данным, Владивостокской епархией до 1922 г. управлял епископ Михаил, по другим – в 1920–1922 епископом Владивостокским являлся Марк (Бакалдин). 25 октября 1922 г. Владивосток захватила народно-революционная армия Дальневосточной республики, 16 ноября Дальневосточная республика вошла в состав РСФСР. В 1923 г. в Приморском крае было национализировано имущество церковных общин, закрыты все монастыри, в 1924 г. в архиерейском доме на Седанке организован дом отдыха. В 1927 г. закрыта церковь – подворье Корейской миссии, в 1932 г. закрыт Успенский кафедральный собор, впоследствии он был разрушен. Из более чем сотни храмов, действовавших в Приморском крае до 1917 г., к концу 1930 гг. сохранились 14. После того как в октябре 1922 г. значительная часть духовенства эмигрировала из Владивостока в Маньчжурию вместе с остатками Белой армии, в Приморье развернули активную деятельность обновленцы, поддерживаемые советской властью. В марте 1923 г. обновленческим Высшим церковным управлением был уволен на покой не признавший ВЦУ управляющий Владивостокской епархией Никольский епископ Павел (Введенский), выслан из Владивостока 7 мая, а епархиальный совет перешёл под контроль обновленцев. По просьбе владивостокского клира временное управление Владивостокской епархией взял на себя епископ Приамурский и Благовещенский Евгений (Зернов). Канонический епархиальный совет по благословению епископа Евгения был воссоздан 18 июля в городе Никольске. В ночь с 29 на 30 августа, сразу после всенощной службы в Благовещенском кафедральном соборе, епископ Евгений был арестован и помещён в благовещенскую тюрьму. В 1925 г. в Приморской губернии обновленцам принадлежало 58 приходов, верными православию оставались 49 храмов, в 1926 г. действовали 57 обновленческих общин и 94 православные.