В 1801 г. «велено старообрядцам в Нижегородской епархии иметь церковь и особенных священников, рукоположённых от епархиального архиерея, для отправления службы Божией по старопечатным книгам, согласно с представлением епископа Вениамина». Вениамин боролся с распространением лжеучений – после проведённого архиереем следствия был наказан «пророк» Кузька, учивший в мордовских селениях Терюшевской волости. В 1800 г. благодаря усилиям Вениамина был отремонтирован кафедральный Спасо-Преображенский собор, при котором построена Предтеченская часовня. В 1809 г. архиерей с крестным ходом перенёс в часовню чудотворный образ Спасителя из запустелого каменного подворья близ приволжских казарм. По распоряжению Вениамина в 1803 г. было устроено отдельное здание для консистории, которая раньше помещалась в семинарском корпусе. Архиерей ходатайствовал о выделении средств для перестройки здания семинарии, заботился о пополнении семинарской библиотеки, а также приходских библиотек. При участии Вениамина в Нижегородской духовной семинарии была переведена с латинского языка и издана книга В. Франца («Historia animalium». Wittenberg, 1621 г.) «История о животных бессловесных» (М., 1803 г., пять частей). В 1808 г. в семинарии было введено преподавание медицины. Вениамин был награждён орденами Иоанна Иерусалимского (1800 г.), св. Анны первой степени (1806 г.), св. Александра Невского (1810 г.). Желая удалиться на покой и посвятить последние дни жизни молитве, велел приготовить себе кельи в Оранской в честь Владимирской иконы Пресвятой Богородицы пустыни, но скончался, не успев исполнить задуманного. Вениамин был погребён в Спасо-Преображенском соборе. После постройки нового здания собора в 1834 г. останки Вениамина были перенесены туда и положены на левой стороне, рядом с гробницами других Нижегородских архипастырей. В 1929 г. собор был взорван, могилы архиереев утрачены. Вениамин является автором широко читавшейся «Священной истории для малолетних детей» (СПб., 1775 г.; в 1778 г. издано параллельно на русском, греческом, латинском, немецком и французском языках, затем неоднократно переиздавалось, последнее издание: М., 1871 г.). Главным трудом Вениамина является сочинение «Новая Скрижаль, или Положительное объяснение о Церкви, о литургии, о всех службах и утварях церковных» (М., 1803 г., четыре части), основанное на латинских комментариях Ж. Гоара к «Евхологию» и не потерявшее своего значения до настоящего времени (многократно переиздавалось, в 1908 г. вышло 17-е издание, последнее издание: М., 1992 г., две части).