Грамоты Свидригайло были подтверждены королём Сигизмундом I (1506–1544 гг.) в 1511 г. После смерти Свидригайло в 1452 г. Волынь вошла в состав Великого княжества Литовского. По выданному жителям Волыни привилею «церковные» люди наравне с княжескими и панскими были освобождены от работ на великокняжеских дворах. Хотя в отличие от католических епископов православные волынские архиереи (Владимирский и Луцкий) не вошли в состав великокняжеской рады, они заняли почётные первые места в «сойме» Волынской земли – собрании местных князей и шляхты, вершившем суд, устанавливавшем местные нормы права, проводившем развёрстку налогов в великокняжескую казну, регулировавшем другие вопросы местной жизни. В сохранившихся свидетельствах о Владимиро-Волынских епископах во второй половине XV – первой половине XVI вв. они упоминаются либо как участники «соймов», либо как свидетели земельных сделок в числе других свидетелей. Лишь о епископе Вассиане (1487–1497 гг.) сохранилось известие, что он окружил кафедральный собор стенами, украсил его иконами, богослужебными сосудами, облачениями и книгами. Владимиро-Волынские архиереи владели достаточно обширными земельными угодьями на Волыни. Кроме участков в самом городе и мельниц в городской округе епископу в 1593 г. принадлежали 11 сёл в Кулечовской волости и 16 сёл во Владимирском и Луцком поветах. В брестской части епархии им принадлежали двор в Бресте с каменной церковью святителя Николая, участки земли в городе и два села. В управлении епархией епископам помогал клирос – собрание священников, служивших в кафедральном соборе. Во второй половине XVI в. в состав клироса входили священники храмов Владимира-Волынского, поочерёдно совершавшие богослужения в кафедральном соборе, во главе которых стоял протопоп. Клирос участвовал вместе с епископом в суде, в частности, по бракоразводным делам. В 1576 г. клирос получил право после смерти епископа до назначения нового архиерея взять под свою опеку кафедральный храм с его имуществом (церковная утварь, документы епископского архива и др.). В 1589 г. владимирский клирос, как и клирос других епархий Западнорусской митрополии, получил право управлять всем имуществом кафедры в период её вдовства. Хотя в документах второй половины XVI в. собрание клирошан неоднократно называется «капитулом», в отличие от этого католического учреждения православный клирос не имел собственных владений. Более того, положение владимиро-волынских священников ухудшилось после аграрной реформы, в результате которой они могли рассчитывать лишь на двойной крестьянский надел. Всё это ослабляло позиции клироса, безрезультатными были попытки владимиро-волынских клирошан в 1580 гг. не допустить расхищения епархиального имущества недостойными архиереями. Во Владимире-Волынском помимо кафедрального собора и резиденции епископа находился ряд православных монастырей. С XIII в. в городе известны монастыри: архангела Михаила, св. Апостолов, Спасо-Преображенский, Ильинский.