Одним из наиболее важных событий в жизни миссии в период управления ею Владимиром было учреждение Филаретовского центрального миссионерского училища в селе Улала (современный Горно-Алтайск) для подготовки учителей, переводчиков и миссионеров. Училище, первоначально существовавшее на средства начальника миссии, переняло метод обучения у Казанской центральной крещенотатарской школы, разработанный Николаем Ивановичем Ильминским. При училище действовали переводческая и иконописная мастерская, иконописную возглавлял иеромонах Антоний (Петров), брат Владимира. Лучшие выпускники направлялись для продолжения образования в Казанскую инородческую семинарию. В 1879 г. в училище воспитывались 18 мальчиков. Владимир активно способствовал переводу богослужебных и других христианских книг на алтайский язык, с 1866 г. совершал богослужения на алтайском языке. В 1876 г. по инициативе и под председательством начальника миссии и при содействии Н.И. Ильминского начали работу Алтайская переводческо-цензурная комиссия и типография, осуществлявшие перевод, цензуру и издание книг на алтайском языке (Евангелие от Матфея, Жития святых, последование всенощного бдения и пр.). Ещё прежде по инициативе Владимира и под его руководством были изданы в Синодальной типографии в Санкт-Петербурге и в Казани с помощью переводческой комиссии братства Гурия Казанского «Алтайско-русский букварь с книгой для чтения» (СПб., 1868 г.), «Евангелия воскресные, читаемые на литургии» (СПб., 1868 г.), «Последования святого Крещения» (СПб., 1868 г.), «Грамматика алтайского языка с алтайско-русским и русско-алтайским словарями» (под редакцией Н.И. Ильминского, Казань, 1869 г.), пять назидательных притч священника Михаила Чевалкова (Казань, 1875 г.), алтайского писателя и переводчика, сотрудника Алтайской миссии. На средства Владимира были открыты центральная миссионерская больница с аптекой, приют для детей в Улале и многое другое. Ему удалось добиться через Казённую палату 3-летней податной льготы для новокрещёных алтайцев, а через Томскую губернскую администрацию – выборности волостных старшин (зайсанов), прежде занимавших свои должности пожизненно, а также независимости новокрещёных селений от зайсанов-язычников. По просьбе Владимира и по ходатайству афонского иеромонаха Арсения (Минина) из Русского Пантелеимонова монастыря на Афоне в миссию был прислан список чудотворной афонской иконы Пантелеимона с частицей его мощей. Святыню из Томска крестным ходом, длившимся с 6 августа по 1 октября 1879 г., донесли до Алтая, где её встретили несколько тысяч крещёных алтайцев, икону поставили в главной миссионерской церкви Всемилостивого Спаса в Улале. Позднее икона прославилась чудотворениями и чтилась не только православными, но также старообрядцами и даже алтайцами-язычниками. 1 декабря 1879 г. Владимир был назначен епископом Бийским, викарием Томской епархии, с оставлением в управлении Алтайской миссией. 13 марта 1880 г. наречён и 16 марта в Благовещенском кафедральном соборе Томска хиротонисан во епископа.