ВИФАНСКАЯ ДУХОВНАЯ СЕМИНАРИЯ учреждена указом императора Павла I Петровича 1 мая 1797 г., после посещения государем Вифанского в честь Преображения Господня монастыря, в указе оговаривалось число учеников в Вифанской семинарии – 100 человек. Открытие семинарии было подготовлено Московским митрополитом Платоном (Левшиным). Во исполнение указа при Троицкой духовной семинарии было создано особое отделение, через три года на берегу Вифанского пруда для новой семинарии построили корпус по проекту архитектора Сергея Ивановича Болдырева (здание, в плане представлявшее собой букву «П», напоминало замок благодаря декоративным башням и рву с подъёмным мостом), открытие Вифанской семинарии состоялось в августе 1800 г. Курс обучения в семинарии делился на низший и высший грамматические классы, классы риторики, философии и богословия. Преподавались словесность, всеобщая история, философия, математика и физика, изъяснительное, созерцательное и нравственное богословие, археология, Священное Писание, церковная история, латинский, греческий, немецкий и французский языки. Большое внимание уделялось изучению древних языков, преподавание велось на латыни. Много времени отводилось занятиям музыкой, из семинаристов были организованы оркестры, которые управлялись специально нанятыми капельмейстерами. В помещении богословского класса размещался оргaн, подаренный Московскому митрополиту Платону графиней Анной Алексеевной Орловой-Чесменской. Семинаристы занимались также декламацией, пением, постановкой мистерий. В 1797–1804 гг. Вифанская семинария находилась под управлением ректора Троицкой духовной семинарии и Московской духовной академии Августина (Виноградского; впоследствии архиепископ Московский), в 1804–1812 гг. ректором Вифанской семинарии был архимандрит Гедеон (Фомин). Материальное положение семинарии в начале XIX в. было прочным, в немалой степени благодаря непосредственному участию митрополита Платона в её обеспечении, все учащиеся находились на казённом содержании. В первые годы семинария была образцовой как в материальном аспекте, так и по составу учащихся – митрополит Платон принимал в семинарию наиболее одарённых учеников и отсылал неспособных в другие семинарии. В 1814 г. в ходе реформы духовного образования было принято решение о закрытии Вифанской семинарии. Московский архиепископ Августин (Виноградский) ходатайствовал о её сохранении, его ходатайство было удовлетворено, и 21 сентября 1814 г. Синод постановил открыть преобразованную Вифанскую семинарию, что и состоялось 5 ноября. Из прежних учеников в неё зачислили 63 человек, 133 учащихся были переведены из Троицкой духовной семинарии, 50 – из бывшей Славяно-греко-латинской академии и 20 – из закрытой Дмитровской духовной семинарии.