Митрополит Кирилл считал, что этот коллегиальный орган коренным образом изменил систему церковного управления (Патриаршее возглавление), и сравнивал его с самочинным григорианским Временным высшим церковным советом (ВВЦС). 18 сентября митрополит Сергий направил письмо митрополиту Кириллу, в котором, отстаивая законность учреждения Временного Патриаршего Синода, разъяснял, что ВВЦС был образован «взамен единоличного заместительства... а Синод утверждён как совещательный орган при первоиерархе». На практике Синод, имея ограниченные полномочия, не мог быть «простой канцелярией», но являлся органом соуправляющим, поскольку ряд актов высшего церковного управления, по меньшей мере, поставление епископов, неизбежным образом должны были носить соборный характер. В 1931 г. во Временный Патриарший Священный Синод были включены митрополит Ташкентский Никандр (Феноменов) и архиепископ Иваново-Вознесенский Павел (Гальковский), в 1932 г. – Управляющий Московской епархией архиепископ Дмитровский Питирим (Крылов). В 1930 гг., для того чтобы приблизить статус и состав Синода к Положению о Священном Синоде, выработанному Поместным Собором 1917–1918 гг., в состав Синода стали вызываться в качестве его временных членов на одну полугодовую сессию в порядке очереди по старшинству хиротонии по пять архиереев РПЦ. Для этого все епархии были распределены на пять групп по географическому принципу, и от каждой группы приглашался один епископ. Остальные архиереи, входившие в состав Синода, имели статусы его постоянных членов. 21 октября 1932 г. в ознаменование пятой годовщины существования Временного Патриаршего Священного Синода указом митрополита Сергия четыре старейших постоянных члена Синода были возведены в митрополитов. Этого титула удостоились архиепископы Хутынский Алексий (Симанский), ставший митрополитом Старорусским, Одесский Анатолий (Грисюк), Ярославский Павел (Борисовский) и Харьковский Константин (Дьяков), сохранившие свои кафедры. В последней зимней сессии Синода за 1934/1935 гг. в качестве его постоянных членов приняли участие митрополиты Ташкентский Арсений (Стадницкий), Ленинградский Алексий (Симанский), Одесский Анатолий (Грисюк), Казанский Серафим (Александров), Ярославский Павел (Борисовский), Киевский Константин (Дьяков), архиепископы Ивановский Павел (Гальковский) и Дмитровский Питирим (Крылов), в качестве временных членов – архиепископы Вятский Киприан (Комаровский), Архангельский Никон (Пурлевский), Курский Онуфрий (Гагалюк), епископы Боровичский Никита (Стягов) и Пятигорский Мефодий (Абрамкин).