Патриаршие послы прибыли зимой 1384 г. в Москву, а Дионисию не суждено было достичь ее. На беду себе он избрал путь из Константинополя через Киев, где в то время сидел озлобленный Киприан. С помощью киевского князя Владимира Ольгердовича он схватил Дионисия и посадил в заключение, где тот менее чем через год скончался (15 октября 1385 г.; в этот день празднуется его память). Между тем патриаршие послы в Москве нашли обвинения против Пимена правильными и лишили его сана. Но Пимен бежал в Константинополь апеллировать на состоявшееся решение и искать восстановления своего звания. Патриарх не думал ставить на Русь нового митрополита, а желал устроить на русской митрополии прежде поставленных: если не Пимена, то Киприана, хотя Киприан, после захвата Дионисия, был вдвойне неугоден московскому князю. Когда Пимен прибыл в Константинополь, патриарх особой грамотой вызвал и Киприана для окончательного суждения: кому из них следует стать митрополитом всея Руси? Князь, не думавший о Киприане, особенно не желал теперь Пимена и с Симоновским архимандритом Феодором послал новые обвинения на Пимена с требованием его окончательного низложения. Ход дела почему-то замедлился, но склонился в сторону полной реабилитации Киприана. Из-за этого Пимен и перешедший на его сторону архимандрит Феодор, по словам греческого документа, стали единомышленниками и, вступив в заговор, дав друг другу клятвы, сделав некоторые взаимные обязательства и вступив в «неподобные» связи, бежали из Константинополя в Анатолию – к туркам, у которых нашли поддержку и осыпали ругательствами и царство, и церковь. Но эта открытая вражда Пимена против патриарха не привела ни к чему. Не явившийся на патриарший Собор по формальному приглашению, Пимен был осужден заочно, и митрополитом всея Руси был утвержден Киприан (в конце 1387, начале 1388 г.). Он, однако, не решился немедленно ехать в Москву, потому что был уверен в нерасположении к себе великого князя, особенно за недавнюю историю с Дионисием Суздальским. Зато Пимен не побоялся возвратиться к князю. Вместе с Феодором он представил великому князю соборный суд патриарха в таком невыгодном свете, что склонили его из двух зол избрать меньшее, т.е. принять Пимена. Несмотря на принятие его князем, Пимен все-таки хорошо сознавал незаконность своего положения и, запасшись деньгами, через несколько месяцев снова отправился в Константинополь добиваться своего оправдания. В это время (1389 г.) Константинопольскую кафедру вместо умершего Нила Керамевса занял патриарх Антоний IV (1389–1390 гг.), который снова соборным актом подтвердил предшествующее решение по делу Киприана и Пимена, так что Пимен, приближаясь к Константинополю, был уже дважды низложенным. Не въезжая в столицу, он хотел было начать переговоры по своему делу из ее предместий, но 11 сентября 1389 г. скончался в Халкидоне. Теперь Киприан остался без соперников. К его благополучию 19 мая 1389 г. умер и не желавший принять его великий князь Дмитрий Иванович, а новый князь Василий Дмитриевич (1389–1425 гг.) согласился принять Киприана, и этим смута закончилась. Во время этой смуты сильно упал в глазах русских нравственный авторитет греков, отголоски чего были видны и впоследствии. Упал также авторитет митрополичьей власти перед властью русских государей, потому что приучил их выбирать себе из нескольких митрополитов более угодного, а неугодного без рассуждений удалять.