С первых шагов на родной земле в новом сане, святитель стал бороться с обычаем кровной мести, который был бичом в стране. Целые семейства погибали из-за взаимной вражды, многие из страха за свою жизнь даже бежали в Турцию, где принимали ислам. Петр где уговорами, где угрозой проклятия мирил поссорившиеся семьи. Также он стремился искоренить в народе воровство и народные обычаи, противоречащие православному учению. Владыка много потрудился на ниве просвещения народа и борьбы с бедностью. В 1796 г. Махмуд-паша Бушатли вновь напал на Черногорию. 1 июля на скупщине в Цетине главы всех племен подписали договор, названный «Стега» («Сплочение»), в котором поклялись помогать друг другу и «пролить кровь свою за христианскую правую веру». 11 июля у селения Мартиничи черногорцы под предводительством своего владыки разбили турок. Сам Махмуд-паша был тяжело ранен. Петр оценил эту победу как «чудо от самого Господа Бога совершившееся, которому славу и хвалу приносим». Но поражение не научило Махмуда-пашу, который в сентябре того же года снова вторгся в Черногорию. 22 сентября 1796 г. у села Крусы черногорцы в упорном бою, длившемся весь день, вновь разгромили турок, а Махмуд был убит, и его голову отнесли в Цетин. Череп скадарского паши и сейчас хранится в особом ларце в монастыре как напоминание будущим захватчикам об ожидающей их участи. Победы при Мартиничах и Крусах утвердили независимость Черногории. Изменилось отношение к черногорцам и у российских правителей. Получив известие о победе черногорцев над турками, императрица Екатерина II незадолго до своей кончины наградила святителя Петра орденом святого Александра Невского с бриллиантами, который был послан в Цетин уже императором Павлом I вместе с Георгиевскими крестами для отличившихся. В 1799 г. новый Российский император, ценивший черногорцев за рыцарство, назначил ежегодную субсидию для Черногории. В 1797 г. пала Венецианская республика, а ее владения в черногорском приморье – Бока Которска и Будва – отошли к Австрии. Это вызвало смятение среди жителей приморских городов, которые обратились к святителю Петру за помощью. Владыка посетил Будву и ее окрестности – Браичи, Побори, Майну – и установил там гражданское правление. Появившийся вскоре австрийский генерал Бради поставил над православными Боки другого владыку. Австрийцы хотели захватить монастырь Майна, давнюю резиденцию Черногорских митрополитов, чтобы превратить ее в свою крепость. Но народное вече, созванное Петром, не позволило им это сделать. Позднее австрийцы просили владыку продать монастыри Майна и Станевичи и получили такой ответ: «Засыпьте эти голые камни золотом, и тогда не удастся вам купить меня вашими деньгами... Что мы саблей добыли, то без сабли не отдадим, хоть бы до колен пролилась геройская кровь». 18 октября 1798 г. на скупщине в монастыре Станевичи был принят первый законник, названный впоследствии «Законник Святого Петра I». Начинавшийся словами «Во имя Господа Спаса нашего Иисуса Христа», законник состоял из 33 пунктов – по числу земных лет Спасителя – и был принят соборно и единогласно с клятвенным целованием креста, Евангелия и мощей великомученика Пантлеймона. Вторая часть законника была принята на скупщине в Цетине 17 августа 1803 г. В 1798 г. I учредил первое черногорское правительство «Кулук». В 1804 г. недруги Петра оклеветали его перед русским императором Александром I, который послал в Черногорию графа Марка Ивелича (уроженца Рисана в Боке Которской) и черногорского посланника при русском дворе архимандрита Стефана Вучетича (желавшего занять место владыки). Ивелич и Вучетич привезли с собой письмо Святейшего Синода, который выдвигал против митрополита и его секретаря Долчи тяжкие обвинения и требовал явиться на суд в Петербург.