В Америке Мелетий близко соотносился с англиканцами. 17 декабря 1921 г. греческий посол в Вашингтоне известил префектуру в Фессалониках, что Мелетий «в облачении принял участие в англиканском богослужении, кланялся с англиканцами на молитве, целовал их престол, проповедовал и позднее благословил присутствовавших!» Когда Священный Синод Элладской церкви узнал о деятельности Мелетия, в ноябре 1921 г. была сформирована специальная комиссия с целью расследования его случая. Между тем, пока расследование ещё продолжалось, Мелетий неожиданно был избран Константинопольским патриархом. Комиссия продолжила работу, и на основании её выводов 9 декабря 1921 г. Синод изверг Мелетия из священного сана за целый ряд нарушений канонического права, а также за учинение схизмы. Вопреки этому решению 24 января 1922 г. он был возведён на Константинопольский престол, а затем, под политическим давлением, постановление о его извержении было отозвано 24 сентября того же года. Митрополит Константинопольского патриаршего Синода Герман (Каравангелис), который в то время законным путём уже был избран Константинопольским патриархом, сообщает об обстоятельствах связанных с неожиданным изменением ситуации следующее: «В отношении моего избрания на Вселенский престол в 1921 году не было сомнений. Из 17 голосов 16 было за меня. Тогда один из моих знакомых мирян предложил мне 10000 фунтов за отказ от всех прав на избрание в пользу Мелетия Метаксакиса. Естественно, я с огорчением и досадой отверг это предложение. Сразу после этого однажды ночью меня посетила делегация «Национальной лиги обороны» из трёх человек и энергично меня убеждала отречься от избрания в пользу Мелетия Метаксакиса. Делегаты говорили о том, что Мелетий может принести 100000 долларов для Патриархии и что он в очень хороших отношениях с протестантскими епископами в Англии и Америке и может быть очень полезен в греческих национальных интересах и что международные интересы требуют избрания Мелетия Патриархом. Такова была и воля Елевферия Венизелоса. Я обдумывал это предложение всю ночь. В Патриархии царил экономический хаос. Греческое правительство перестало присылать помощь, а других источников дохода не было. Жалование не выплачивалось девять последних месяцев. Благотворительные организации Патриархии были в критическом материальном состоянии. Из этих соображений и ради народного блага я принял это предложение». После этого договора, 23 ноября 1921 г., было принято предложение Синода Константинопольской патриархии отложить избрание патриарха. Сразу за тем, епископы, голосовавшие за то, чтобы отложить избрание, были заменены другими, так что два дня спустя, 25 ноября 1921 г. Мелетий был избран. Отстранённые епископы тем временем встретились в Фессалониках и издали сообщение о том, что «избрание Мeлетия совершено противно святым канонам», и обещали, что проведут «честное и каноническое избрание Патриарха Константинополя». Спустя два месяца Мелетий всё-таки стал Константинопольским патриархом, с помощью политических кругов около Венизелоса и англичан. Возведение Мелетия на Константинопольский престол произошло в разгар греко-турецкой войны, в которой союзники во главе с Англией поддержали греческую попытку захвата у Турция обширных территорий в Малой Азии.