В 1054 г. Михаил I Керуларий созвал в Константинополе Собор, на который прибыли папские легаты во главе с кардиналом Гумбертом. Прибыв в Константинополь, они вели себя очень гордо, уверенные в необходимости помощи Рима для Константинополя. Гумберт крайне высокомерно обошёлся как с восточными иерархами (в частности, с патриархом Михаилом I Керуларием), так и с самим императором. Явившись на созванный патриархом Собор, легаты, не сделав даже приветствия Собору, подали патриарху послание папы, «приняв тон и вид учителей негодных учеников». Только благодаря вмешательству императора Константина IX Мономаха папские легаты были спасены от расправы константинопольского населения (как послы иностранного государства). В результате этого Михаил I Керуларий отказался признать их законными представителями папы Римского и, отправив послания к другим восточным патриархам, в которых опровергал особенности Римской церкви, закрыл Собор. Император, между тем, устроил прения легатов с учёным монахом Никитой Стифатом (около 1005 – около 1090 гг.), пресвитером Студийского монастыря, издавшим против латинян целое сочинение, но теперь, по приказанию императора, отказавшимся от своих мнений. Закрытые Михаилом I Керуларием латинские церкви в Константинополе были вновь открыты, но патриарх запретил своей пастве общение с легатами. Между тем умер папа Лев IX. Легаты, соскучившись, как они говорят, сопротивлением Михаила I Керулария, явились в храм Святой Софии и возложили на алтарный престол отлучительную грамоту, в которой, обвиняя Михаила I Керулария в разных ересях, изрекали на него и на всю восточную церковную иерархию анафему. Данное деяние было квалифицировано как грубейшее нарушение церковной и политической этики. Через день император, после совещания с патриархом, снова пригласил легатов на совещание. Но при публичном чтении их отлучительной грамоты народ пришёл в такое негодование, что сам император поспешил удалить их собрания. Затем они уехали из Константинополя. 20 июля 1054 г. под руководством Михаила I Керулария, 12 митрополитов и несколько архиепископов подписали соборное определение Синода о проклятии папских легатов и незаконности их действий (вернее, отсутствии полномочий, ввиду смерти Льва IX на момент вручения грамоты). Уже после смерти папы Льва IX Михаил I Керуларий созвал ещё один Собор, на котором была провозглашена анафема легатам от имени Восточной церкви. Таким образом, роль патриарха Михаила I Керулария в общецерковной истории состояла в качестве, так сказать, «фиксатора» церковного разделения и защитника позиций как семи Вселенских соборов, так и позиции Вселенской церкви. Он заставил императора согласиться с этим расколом. Анафема легатов не была признана Западной церковью. Не позже, чем через два года после неё, когда патриархом был тот же Михаил I Керуларий, один из легатов, став папой под именем Стефана IX (1057–1058 гг.), отправил новое посольство в Константинополь с целью примирения, причём во главе посольства поставил не Гумберта, а кроткого и умного аббата Дезидерия. В 1071 г. такое же посольство было отправлено папой Александром II (1061–1073 гг.), в 1082 г. – папой Григорием VII (1073–1085 гг.). С другой стороны, Соборам, созванным Михаилом I Керуларием по случаю прибытия легатов, Восточная церковь никогда не придавала канонического значения. Довольный своей победой, Михаил I Керуларий организовал восшествие на трон Михаила VI Стратиотика (1056–1057 гг.) и помог ему укрепиться у власти, а через год заставил нового императора уйти с престола и поставил вместо него в 1057 г. Исаака I Комнина (около 1057–1059 гг.). Позже, когда Исаак I Комнин решил присвоить себе имущество церкви, Михаил I Керуларий отказался подчиниться такому решению. Конфликт между патриархией и империей обострялся. Михаил I Керуларий, уверенный в поддержке общества, сыпал угрозами, выдвигал требования и прибегал к насилию. Один историк того времени заметил, что он публично предсказывал падение императора, вёл себя вызывающе и пренебрежительно. В результате разногласий Михаил I Керуларий был в конце 1058 г. смещён императором Исааком I Комниным и сослан на остров Имброс. Часть монастырских земель была конфискована. Михаил I Керуларий погиб по пути в ссылку 21 января 1059 г., в результате крушения корабля в бурю.