Фактически епископ Пантелеимон (Рудык) был епископом Львовским номинально, т.к. почти все приходы Галиции с началом оккупации летом 1941 г. вернулись в юрисдикцию митрополита Варшавского и всея Польши Дионисия (Валединского) и подчинённого ему епископа Краковско-Лемковского Палладия (Видибиды-Руденко), с 13 августа 1941 г. титуловавшегося епископом Краковско-Лемковско-Львовским. В декабре 1941 г. епископ Пантелеимон (Рудык) переехал в Киев, став временно управляющим Киевской епархией, с сохранением за ним титула «Львовский». В конце 1943 г. архиепископ Пантелеимон (Рудык) покинул Украину, с тех пор Львовская кафедра в юрисдикции Московского патриархата и фактически, и юридически не существовала. После изгнания из края немецких оккупантов в 1944 г. в Галиции оставались действующими десять православных общин, в том числе три прихода во Львовской области, два прихода в Дрогобычской области, четыре прихода в Станиславской области и приход в южной части Тернопольской области. В 1944–1945 гг. власти не форсировали открытые переходы в православие отдельных униатских общин, проводя подготовку коллективного присоединения, новообразованные православные общины власти обеспечивали культовыми зданиями других конфессий, передавая им католические костёлы и лютеранские кирхи, опустевшие в связи с выселением из Галиции польских и немецких общин (в городе Станислав новообразованному Троицкому приходу было передано здание бывшей кирхи, в городе Сокаль в бывшем костёле был открыт первый в городе православный храм). 10 марта 1945 г. принято решение Синода о назначении на Львовско-Тернопольскую кафедру епископа Никона (Петина), но уже 18 апреля решение было отменено ввиду незнания им украинского языка. 22 апреля 1945 г. во епископа Львовского и Тернопольского был рукоположён Макарий (Оксиюк), который начал активное сотрудничество с униатским священником Гавриилом Фёдоровичем Костельником по возвращению униатов в православие. В начале 1945 г. во Львовской области в православие перешли первые пять приходов: в сёлах Дмитровичи Винниковского района и Долиняны Городокского района, посёлка Поморяны Поморянского района, в сёлах Стрептов Новомилятинского района и Вороблячин Немировского района. С образованием Инициативной группы 28 мая 1945 г. переход униатских общин в православие стал массовым явлением. 3 августа уполномоченный по делам Русской православной церкви по Львовской области А.А. Вишневский сообщил руководству Совета по делам Русской православной церкви, что с просьбой о принятии в Инициативную группу поступило 50 заявлений от священников Львовской области. На 1 октября 1945 г. кроме девяти полноценных приходов с храмами существовали также две православные общины в городе Броды и посёлке Щирец, которые совершали богослужения в униатских храмах поочерёдно с общинами УГКЦ.