Как специалист по христианскому Востоку, Фэри фон Лилиенфельд была членом Совещательного комитета КЕЦ (1967–1986 гг.); членом комиссии Евангелической церкви Германии по диалогу с РПЦ; членом комиссии Лютеранского всемирного союза по диалогу с вселенским православием (1979–1992 гг.); членом учебного комитета Объединённой Евангелическо-лютеранской церкви Германии по связям с православными церквами; членом Восточноевропейского совета специалистов по вопросам Восточной Европы при Евангелическо-лютеранской церкви Баварии. Фэри фон Лилиенфельд активно содействовала процессу политического примирения и нормализации отношений между СССР и ФРГ, выступая за ратификацию Восточных договоров (первый договор подписан в августе 1970 г.), за что неоднократно подвергалась критике со стороны противников мирного урегулирования отношений двух стран. Фэри фон Лилиенфельд занималась систематизацией хранящейся при её кафедре части Московской Синодальной библиотеки, около 6000 томов которой были проданы в Баварию советским акционерным обществом «Международная книга» и выкуплены университетом Эрлангена в 1934 г. с целью создания института по исследованию православных церквей. В преддверии 1988 г. именно Фэри фон Лилиенфельд обратила внимание западногерманской и американской общественности на трагическую судьбу РПЦ в XX в. и на приближающийся юбилей 1000-летия Крещения Руси. Совместно с профессором Георгом Кречмаром (впоследствии архиепископ Евангелическо-лютеранской церкви в России, Украине, Казахстане и Средней Азии), Карлом Христианом Фельми, своим учеником (впоследствии заведующий кафедрой), Клаумо-Юргеном Рёпке, руководителем Евангелической академии в Тутцинге, Фэри фон Лилиенфельд организовала в 1987 г. конференцию в Тутцинге, посвящённую русскому православию, имевшую большой международный резонанс; ряд конференций по этой тематике прошёл также в США. По мысли Фэри фон Лилиенфельд, христианизация имела для Руси историческое значение и привела к возникновению Древнерусского государства с уникальной культурой – языком, литературой, архитектурой, музыкой и церковной традицией. Однако в советской исторической науке и славистике этот тезис, подчёркивающий решающую роль христианизации в истории Древней Руси, вызвал критику и неприятие. На конференции присутствовали 140 гостей (богословы, слависты, историки, византинисты) из 18 стран. Здесь впервые при участии представителей РПЦ состоялась открытая дискуссия международного уровня о судьбе Русской церкви в советский период.