По мнению Фэри фон Лилиенфельд, преподобный, редактируя монашеские Жития на основе греческих первоисточников, пытался восстановить подлинные тексты. Фэри фон Лилиенфельд считала, что Нил Сорский не был абсолютным противником общежительных монастырей и видел в них необходимую ступень на пути к скитской форме монашеской жизни. Неразрешимая проблема русских киновий, по мнению Фэри фон Лилиенфельд, состояла в неразрывности общежительного устава с владением вотчинами, против чего выступал преподобный, подчёркивая, что интересы монашества – чисто аскетического, духовного свойства (даже благотворительность он считал делом мирским, приходским). В 1962 г. Фэри фон Лилиенфельд была ординирована в пастора и стала штатным доцентом церковной истории в Высшей катехизической семинарии города Наумбурга со специализацией в области Восточных церквей и русского православия. Она руководила созданной в 1963 г. научной рабочей группой (Кружок Меланхтона (Melanchthon-Arbeitskreis)) по изучению Восточных церквей, в состав которой входили профессора Герман Готфрид Гольц, Ханс Георг Тюммель, Гюнтер Шульц (с 1966 г. – преемник Фэри фон Лилиенфельд в руководстве кружком), Х.К. Дидрих и др. Члены научной группы изучали церковнославянские и греческие литургические и богословские тексты в оригинале, посещали богослужения в храмах Среднеевропейского экзархата РПЦ, входили в состав специальных комиссий Евангелической церкви Германии по вопросам диалога с православными церквами. В 1966 г. Фэри фон Лилиенфельд получила должность профессора на только что созданной кафедре истории и богословия Восточных церквей в западногерманском университете города Эрлангена, где занималась изучением и преподаванием патристики, литургики, религиозной философии, постоянно давала научные и церковные консультации. Созданная ею концепция кафедры предполагала изучение языков Восточных церквей, а также проведение лекций и семинаров по византийской, балканской и русской церковной истории и богословию. С кафедрой сотрудничали преподаватели и студенты исторического факультета, славистики, востоковедения и др., а также церковные, научные и учебные заведения Римско-католической церкви: византийская декания бенедиктинского монастыря Нидеральтайх, Институт Восточных церквей в Регенсбурге (под патронатом Немецкой католической епископской конференции), Институт Восточных церквей августинцев в Вюрцбурге. Фэри фон Лилиенфельд была убеждённой противницей чисто научного подхода к изучению православных церквей и считала обязательными посещения богослужений в православных приходах и монастырях, а также личные контакты с представителями православия.