Судя по всему, во время этой поездки состоялась беседа с оптинским старцем Анатолием, после которой, по воспоминаниям С.С. Безобразова, у него в душе зародилась мысль о монашестве и священстве (Центральный государственный архив Санкт-Петербурга). В августе 1921 г. С.С. Безобразов был отстранён от работы в Петроградском университете и, очевидно, по ходатайству Ю.П. Новицкого избран профессором Педагогического института социального воспитания дефективного ребёнка при Психоневрологической академии на кафедре истории культуры (Центральный государственный архив Санкт-Петербурга). В 1921/1922 учебном году С.С. Безобразов приступил к регулярному чтению лекций в Петроградском Богословском институте, который был учреждён 20 апреля 1920 г., после закрытия Санкт-Петербургской духовной академии. 21 августа 1921 г. он прочёл в Богословском институте публичную лекцию «Социологический вопрос в древней Церкви», а 23 апреля 1922 г. – «Промысел Божий в приготовлении рода человеческого к принятию Христа Спасителя». Одновременно читал лекции в церквах Петрограда, вёл курс Священного Писания Нового Завета на Василеостровских богословских курсах (Центральный государственный архив Санкт-Петербурга). В течение второго и третьего триместра 1921/1922 учебного года преподавал студентам второго курса историю религии и участвовал в организации занятий библейского кружка. На летний период обучения составил план семинаров по Новому Завету, которые должны были продолжить курс, прочитанный в институте его предшественником профессором Л.П. Карсавиным. В июне 1922 г. С.С. Безобразов присутствовал на нескольких заседаниях публичных слушаний дела об изъятии церковных ценностей, последние слова митрополита Вениамина (Казанского) и других подсудимых 5 июля, на закрытии процесса, сохранились в его памяти на всю жизнь. 9 сентября подал заявление с просьбой «ввиду расстроенного здоровья» освободить его от обязанностей секретаря Богословского института, должности, которую он занимал, по мнению исследователей, с мая 1922 г. (Центральный государственный архив Санкт-Петербурга). По настоянию своего духовника приходского священника Казанского собора протоиерея Тимофея Налимова (бывшего профессора Санкт-Петербургской духовной академии, избранного в 1906 г. её ректором) С.С. Безобразов уехал из Петрограда и 16 сентября 1922 г. нелегально пересёк государственную границу с Латвией. В том же году приехал в Белград, где воссоединился с родителями и сестрой. До 1925 г. преподавал в первой русско-сербской гимназии в Белграде. В 1923 г. стал участником студенческого кружка (с 1924 г. – кружок имени Серафима Саровского), который собирался в белградской квартире семьи Николая Михайловича Зёрнова, здесь он познакомился с митрополитом Антонием (Храповицким), епископом Николаем (Велимировичем), Константином Эдуардовичем Керном (впоследствии архимандрит Киприан), профессором В.В. Зеньковским и Николаем Николаевичем Афанасьевым. Весной 1923 г. вместе с В.В. Зеньковским и С.М. Зёрновой участвовал в качестве наблюдателя в работе конференции Христианской студенческой федерации в Будапеште, организованной Всемирной христианской студенческой федерацией.