Его кисти принадлежит фреска с изображением царицы Тамары в церкви Пресвятой Богородицы в Дидубе (Тбилиси); в соавторстве с ним разработана иконография Спасителя для росписи в куполе Самеба. Католикосу-Патриарху принадлежат также живописные и скульптурные портреты известных грузинских мирян. Илия II является почётным членом Московской духовной академии (с 1978 г.); почётным доктором богословия Нью-Йоркской духовной академии (с 1991 г.); действительным членом Международной академии информатизации при ООН и почётным членом Критской духовной академии (с 1997 г.); почётным доктором богословия Свято-Тихоновской духовной семинарии православной церкви в Америке (с 1998 г.); почётным доктором богословских наук Тбилисского государственного университета (с 2003 г.); почётным членом Академии Наук Грузии (с 2005 г.). Имеет много церковных наград и светских знаков отличия, среди которых – ордена равноапостольной Нины и великомученика Георгия (ГПЦ) «за усердное служение Церкви Христовой» (1972 и 1977 гг.); орден св. Иоанна Рильского первой степени (БПЦ; 10 мая 1977 г.); орден Дружбы народов «за большую патриотическую деятельность в защиту мира и в связи с 50-летием»; орден св. царя Давида IV Строителя (высшая государственная награда Грузии) «за восстановление независимости Грузинской Православной Церкви, за духовное и физическое спасение грузинского народа, за особый вклад в строительство государственности и борьбу за воссоединение страны» (1997 г.); орден Славы (высшая государственная награда Азербайджана) «за развитие отношений между Грузией и Азербайджаном» (июнь 2005 г.); Золотой орден хитона Господня (ГПЦ) «за неоценимые заслуги перед грузинским народом» (27 июня 2008 г.); орден Культурного наследия (Международная федерация русскоязычных писателей стран СНГ) «за просветительскую и общественную деятельность, социальную ответственность и значительный личный вклад в дело сохранения и приумножения мирового культурного наследия» (июль 2008 г.); орден князя Ярослава Мудрого третьей степени (Украина) «за многолетнее пастырское служение и милосердно-благотворительную деятельность, за выдающийся личный вклад в развитие грузино-украинских духовных связей» (17 октября 2008 г.) и многие другие. Деятельности Илии II посвящены документальные фильмы «В гостях у Патриарха» (режиссер Г. Шалуташвили, 2007 г.) и «Крест Патриарший» (режиссер Г. Торадзе, 2007 г.), книга «Патриарх» (2005 г.), монографическое исследование С. Вардосанидзе «Святейший и Блаженнейший Католикос-Патриарх всей Грузии Илия II» (2008 г.) и книга-альбом «Солнечная ночь» (2008 г.). Исследователи отмечают, что последнее название – это слова, принадлежащие Илии II, которыми он характеризует период своего патриаршества.