Из-за скученности населения, голода, эпидемий многие люди умирали. Переселенцы обвиняли Игнатия в своих бедах, но его усилиям противодействовало руководство Азовской губернии, прежде всего, губернатор Василий Алексеевич Чертков. Игнатий протестовал против насильственного поселения греков в местах, выделяемых без учёта их желания. Писал просьбы и жалобы в разные инстанции, после обращения в начале мая 1779 г. к князю Григорию Александровичу Потёмкину был приглашён в Санкт-Петербург, где участвовал в согласовании мест проживания переселённых христиан. 21 мая Екатерина II подписала жалованную грамоту, согласно которой выходцам из Крыма даровались свободы и привилегии. Благодаря настойчивости Игнатия ордером Г.А. Потёмкина от 29 сентября того же года, а затем указом Екатерины II от 2 октября для греков был создан Мариупольский уезд. В апреле 1780 г. началось его заселение, строился Мариуполь, названный в честь Божьей Матери, появился Мариупольский греческий суд – орган, выполняющий административные, полицейские и судебные функции в уезде. На новых землях греки получили значительные земельные наделы, были освобождены от рекрутской повинности, не разрешалось размещение воинских частей в их населённых пунктах. Уже в 1780 г. Игнатий выстроил в Мариуполе несколько церквей: Харалампиевскую соборную, Рождества Пресвятой Богородицы, великомученика Феодора Стратилата и Успенскую, куда была помещена старинная икона Божьей Матери «Одигитрия», привезённая из Крыма. Участвовал в строительстве и освящении сельских церквей уезда. Игнатий поселился в Мариуполе, первоначально жил в убогой землянке. 7 сентября 1780 г. в его доме был пожар, уничтоживший многие документы по истории Готской и Кафской епархии и переселения греков в Россию. После этого для него был построен удобный дом. Для отдыха он избрал дачу в 5 км от города вверх по реке Кальмиус, где ему была выделена земля площадью 1500 десятин. Он развёл там фруктовый сад, выстроил каменную келью. Планировал основать в этом месте монастырь во имя Георгия Победоносца. Из-за голода и новых людских потерь напряжённые отношения между Игнатием и частью греческой общины сохранялись и в Мариуполе.