Тогда же был возведён киворий, орнаментированный перламутром и черепашьим панцирем. Cправа от престола Св. Эчмиадзин был освящён престол Святого Синая (нынешний относится к 1742 г.); под ним лежат три валуна, принесённые с Синая, Фавора и Иордана. К северной стене собора примыкает церковь св. Мины Александрийского с парой алтарных апсид, в которых освящены престолы св. Мины и св. Сергия; все ячейки перекрыты крестовыми сводами. Восточнее к северной стене собора примыкает церковь св. Стефана Первомученика, разделённая на нефы двумя столбами. В ней освящены престолы св. Стефана, святителей Григория Просветителя и Кирилла Иерусалимского. Здесь хранится купель, в которой, по преданию, он крестил более 100 тыс. человек, которые уверовали, увидев на небе крест, распростёршийся от Голгофы до Елеонской горы. По сторонам входа в церковь св. Мины устроены крошечные приделы св. Макария Иерусалимского, с надгробной мраморной плитой (1751 г.) и апостола Иакова Зеведеева, где, по преданию, Богородицей была погребена его глава (полностью облицован бело-серым резным мрамором). По некоторым предположениям, церковь св. Мины и придел апостола Иакова Зеведеева были первыми постройками на этом месте и относятся к V в. В том же веке в них служил армянский священник Андреас Мелитенеци. Выше, непосредственно на сводах приделов, устроены ещё три придела: в честь иконы «Знамение», во имя св. Апостолов и в честь Вознесения. Ансамбль монастыря святых Иаковов состоит из большого числа построек, многие из которых тесно примыкают друг к другу. К северо-востоку от собора расположена церковь св. Феодора, возведённая армянским киликийским царём Хетумом I (1226–1270 гг.) или, по другим данным, Хетумом II (1289–1293, 1295–1296, 1299–1303 гг.); эта базилика убранством похожа на собор монастыря. Справа от алтаря находится часовня св. Маркерия, откуда можно пройти в часовню св. Иоанна Крестителя, служащую ризницей, где хранятся рукописные фонды монастыря святых Иаковов. К юго-востоку находится церковь св. архангелов Михаила и Гавриила, построенная, по преданию, царём Авгарем и императрицей равноапостольной Еленой на месте дома первосвященника Анны, в который привели Иисуса Христа для судилища. Иерусалимский армянский патриархат располагается в здании, построенном в 1853 г. к югу от собора; на втором этаже – канцелярия и просторный приёмный зал, увенчанный куполом. Рядом расположена типография, созданная в 1865 г. патриархом Есайей, – первая в Палестине, южнее – библиотека имени К. Гульбенкяна, построенная на средства этого мецената в 1929 г., и музей имени Э. и Е. Мардикянов. Монастырское хранилище рукописей в церкви св. Феодора занимает второе по значимости и количеству рукописей место после собрания Матенадарана в Ереване и содержит более 4 тыс. манускриптов, многие киликийского происхождения, в том числе шесть рукописей с миниатюрами Тороса Рослина. Патриархия имеет большое художественное собрание, основу её коллекции составляют произведения армянского искусства. Духовенство и братия монастыря святых Иаковов ежедневно служат в соборе, а также в храмах Гроба Господня, Рождества Христова в Вифлееме и других церквах Святой земли, полностью или частично принадлежащих ААЦ. При монастыря святых Иаковов действуют средняя школа и коллегиум Таргманчац (св. Переводчиков; основаны в 1925 г.) с 12-летним обучением, семинария Жарангаворац («Наследующие»; основана в 1843 г.) с шестилетним, а также высшая духовная школа Энцаяран с трёхлетним обучением.