На миниатюре из Минология Василия II (первая четверть XI в.) Исидор Пелусиот изображён вполоборота вправо, его взор обращён к небесному сегменту, из которого исходят лучи, руки протянуты в молении; в пейзажный фон с горками и редкой растительностью включены архитектурные сооружения. В минейных циклах настенных росписей ряда балканских храмов образ Исидора Пелусиота помещён под 4 февраля: в церкви Георгия в Старо-Нагоричино (1317–1318 гг.) – поясной образ; в церкви святителя Николая в Пелинове (1717–1718 гг.) – погрудно; под 6 февраля: в притворе церкви св. Апостолов в Пече (1561 г.) – погрудно; на фреске церкви Святой Троицы монастыря Козия в Валахии, Румыния (около 1386 г.),– в рост. Неясным для исследователей остаётся изображение под 4 февраля в настенном минологии церкви Христа Пантократора монастыря Дечаны (около 1350 г.), где поименованный Исидором святой изображён в огне. Начало XIV в. датирована каменная иконка из сланца новгородского происхождения (Русский музей). На её лицевой стороне – рельефное изображение трёхфигурного Деисуса, на обороте – ростовые образы Николая Чудотворца и святого с надписью: «СIДОРЪ». Для исследователей очевиден патрональный заказ этой нагрудной иконки (вверху есть отверстие для шнура, размеры: 5,3×4,6×1 см), обусловивший выбор святых для оборотной стороны. Уверенно идентифицировать изображённого здесь святого как Исидора Пелусиота исследователям позволяют характерные для изображения преподобных жест (в левой руке держит свиток, правая в молении) и монашеская одежда. В русские минейные циклы образ Исидора Пелусиота включается в соответствии с днём его памяти и отличается устойчивостью. На минейной иконе на февраль из годового комплекта миней, происходящего из церкви Димитрия Прилуцкого на Наволоке в Вологде (конец XVI в., Вологодский государственный историко-архитектурный и художественный музей-заповедник), а также на эмалевой иконе-минее на февраль (вторая половина XVIII в., Исторический музей) Исидор Пелусиот показан в паре с Кириллом Новоезерским. На иконе-минее на февраль (вторая четверть XVII в., Ярославский историко-архитектурный и художественный музей-заповедник) в опущенной левой руке Исидора Пелусиота закрытый свиток, правая отведена в сторону (из-за утраты красочного слоя жест исследователям неясен – благословения или учительный); на иконе из Церковно-археологического кабинета Московской духовной академии (начало XVII в.) Исидор Пелусиот держит свиток в правой руке перед грудью, левая скрыта мантией. На минее на февраль с образами Богородицы на полях (конец XIX в., частное собрание) святые изображены не статично, а в общении друг с другом: Исидор Пелусиот обращён к великому князю Георгию Всеволодовичу, память которого приходится также на 4 февраля, их руки соприкасаются (Исидор Пелусиот вручает князю свиток (?)), в опущенной правой руке он держит свиток. Образ святого включён в роспись южной галереи церкви апостола Иоанна Богослова в Ростове (1683 г.) – на откосе оконного проёма.