Образ Иоанна Рильского (не сохранился) имелся в Новоиерусалимском монастыре (1656 г.). На позднюю (конец XVII – XIX в.) иконографию Иоанна Рильского оказала заметное воздействие украинская (киевская) книжная гравюра. В киевском издании 1671 г. есть две гравюры с образом Иоанна Рильского, никак не связанные с более ранней (как балканской, так и древнерусской) иконографической традицией изображения этого святого. Первая из них, помещённая перед службой святому, как установил Д. Кенанов, является повторением (с заменой имени) гравюры издания Киево-Печерского патерика 1661 г. работы мастера монаха Илии, изображающей Нестора Летописца. Вторая гравюра (перед Житием), изображающая Иоанна Рильского с его племянником Лукой, представляет зеркальный вариант (с заменой ряда второстепенных деталей и имён) гравюры «Преподобный авва Дорофей и ученик его Досифей» из киевского издания Поучений аввы Дорофея 1628 г.; она послужила оригиналом для болгарской храмовой иконы Иоанна Рильского конца XVIII в., хранящейся в музее Рильского монастыря. В период болгарского национального возрождения (конец XVIII – XIX вв.) образ Иоанна Рильского получил известность в искусстве Афона. Изображения святого появились как в болгарском монастыре Зограф и в его скитах, так и в монастырях Хиландар и русском великомученика Пантелеимона. Во второй половине XVIII – XIX вв. на территории Болгарии и современной Македонии были очень популярны гравюры с образом святого и изображением Рильского (реже Германского) монастыря в окружении клейм из жития Иоанна Рильского или со сценой перенесения его мощей; эти иконы на средства монастыря печатались также и в Вене (например, гравюра 1844 г. с десятью сценами из Жития, перенесением мощей и видами обители). В первой половине XIX в. многочисленные сцены из жизни святого (в том числе успение и перенесение мощей) были помещены в соборе Рильского монастыря. Изображения Иоанна Рильского сохранились также на предметах прикладного искусства. Так, на лицевой стороне кованого оклада Крупнишского Евангелия 1577 г. (Библиотека Рильского монастыря) Иоанн Рильский представлен с непокрытой головой с короткими волосами, рука лежит на груди. Его образ есть на потире из Врацы (ХVIII в.) и на двух мощехранительницах из Рильского монастыря (ХIХ в.). Иоанна Рильского изображали и на различных шитых предметах церковного обихода: хоругвях, поручах и др.