С 1990 г. выходит ежемесячная газета «Православный голос Кубани», включающая приложение для детей и юношества «Подсолнушек». Ряд благочиний и монастырей также издают газеты и журналы. Во многих светских газетах, в том числе крупнейших в крае «Кубань сегодня» и «Вольная Кубань», ведутся православные рубрики. На краевом телевидении епархия выпускает программу «Отчий дом», совместно с Государственным научно-творческим учреждением «Кубанский казачий хор» устраивает фестиваль православных фильмов. Выходят в эфир программы православной радиостанции епархии «Воскресение». По благословению Исидора созданы и успешно функционируют православные учебные заведения: Екатеринодарская духовная семинария (2006 г.), Армавирский православно-социальный институт (1993 г.), православные общеобразовательные учреждения (школы, гимназия, кадетский казачий корпус). Под руководством Исидора епархия ведёт работу в сотрудничестве с департаментом образования и науки, самыми значимыми совместными мероприятиями стали ежегодные Всекубанские духовно-образовательные Кирилло-Мефодиевские чтения в Краснодаре (с 1995 г.), Благовещенский православно-педагогический форум, проходящий в дни весенних каникул во Всероссийским детском центре «Орлёнок». Также с 2007 г. устраиваются Всекубанские Екатерининские чтения на тему «Православие и наука в XXI в.». В епархии были организованы православные библиотеки, которые выполняют традиционную просветительскую функцию. Крупнейшие православные библиотеки Краснодара – «Троицкое слово», где также священнослужители читают лекции и проводят встречи с читателями, библиотека имени равноапостольных Кирилла и Мефодия при просветительной краснодарской общественной организации «Православная книга». Осуществляется взаимодействие епархии с краевыми государственными структурами. 30 марта 2011 г. Исидор подписал соглашение с краевым ГУ МЧС, которое по сравнению с соглашением 2007 г. предусматривает возможность обучения специальным навыкам священнослужителей и сестёр, работающих в условиях чрезвычайных ситуаций, обеспечения их доступа к пострадавшим в чрезвычайных ситуациях, помощи со стороны церкви в подготовке сотрудников МЧС и др. С благословения Исидора паства епархии объединяется в церковно-общественные и благотворительные организации: научно-методический и миссионерский центры при Екатеринодарском епархиальном управлении, православный молодёжный центр, общество православных педагогов, общество православных врачей, православную просветительскую организацию «Вера» (2000 г.), патриотический клуб имени Александра Невского при православной библиотеке «Семья», краснодарское краевое духовно-просветительское общество «Наследники Александра Невского» и др. В епархии действуют детские дома при краснодарском храме Рождества Христова и монастыре в честь иконы Божьей Матери «Нерушимая Стена», а также краевой епархиальный центр реабилитации наркозависимых. Исидор является многолетним участником постоянно действующей «Акции милосердия», которую проводит епархиальное управление для детей-инвалидов. Решением Священного Синода от 12 марта 2013 г. Исидор назначен главой Кубанской митрополии и временным управляющим Армавирской и Тихорецкой епархиями. Награждён орденами Сергия Радонежского второй степени (5 марта 1987 г.), князя Даниила Московского второй степени (1997 г.), святителя Иннокентия второй степени (2002 г.) и орденами поместных православных церквей. Имеет государственные награды: медаль ордена «За заслуги перед Отечеством» второй cтепени (28 декабря 2000 г.), орден Почёта (29 мая 2007 г.) и многие общественные награды и знаки отличия.